Protein–RNA interactions for Protein: Q78YZ6

Scoc, Short coiled-coil protein, mousemouse

Predictions only

Length 125 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ScocQ78YZ6 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
ScocQ78YZ6 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
ScocQ78YZ6 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
ScocQ78YZ6 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
ScocQ78YZ6 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
ScocQ78YZ6 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
ScocQ78YZ6 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
ScocQ78YZ6 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
ScocQ78YZ6 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
ScocQ78YZ6 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
ScocQ78YZ6 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
ScocQ78YZ6 Sel1l-204ENSMUST00000167466 5544 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
ScocQ78YZ6 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
ScocQ78YZ6 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
ScocQ78YZ6 Amotl2-211ENSMUST00000153965 4222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
ScocQ78YZ6 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
ScocQ78YZ6 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
ScocQ78YZ6 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
ScocQ78YZ6 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
ScocQ78YZ6 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
ScocQ78YZ6 Gm9951-202ENSMUST00000149618 1772 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
ScocQ78YZ6 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
ScocQ78YZ6 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
ScocQ78YZ6 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
ScocQ78YZ6 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
ScocQ78YZ6 Col24a1-201ENSMUST00000029848 7143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
ScocQ78YZ6 Slit2-216ENSMUST00000174313 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
ScocQ78YZ6 Dclk2-202ENSMUST00000191752 8042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
ScocQ78YZ6 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
ScocQ78YZ6 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
ScocQ78YZ6 Tor1aip1-202ENSMUST00000097527 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
ScocQ78YZ6 Cd93-201ENSMUST00000099269 6677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
ScocQ78YZ6 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
ScocQ78YZ6 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
ScocQ78YZ6 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
ScocQ78YZ6 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
ScocQ78YZ6 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
ScocQ78YZ6 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
ScocQ78YZ6 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
ScocQ78YZ6 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
ScocQ78YZ6 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
ScocQ78YZ6 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
ScocQ78YZ6 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
ScocQ78YZ6 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
ScocQ78YZ6 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
ScocQ78YZ6 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
ScocQ78YZ6 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
ScocQ78YZ6 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
ScocQ78YZ6 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
ScocQ78YZ6 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
ScocQ78YZ6 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
ScocQ78YZ6 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
ScocQ78YZ6 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
ScocQ78YZ6 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
ScocQ78YZ6 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
ScocQ78YZ6 Gm37105-201ENSMUST00000192251 2085 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
ScocQ78YZ6 Tnn-202ENSMUST00000131919 3987 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
ScocQ78YZ6 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
ScocQ78YZ6 Lrfn5-201ENSMUST00000055815 4410 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
ScocQ78YZ6 Cacna1c-205ENSMUST00000112825 7577 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
ScocQ78YZ6 Nsl1-202ENSMUST00000078259 4879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
ScocQ78YZ6 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
ScocQ78YZ6 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
ScocQ78YZ6 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
ScocQ78YZ6 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
ScocQ78YZ6 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
ScocQ78YZ6 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
ScocQ78YZ6 Asap1-203ENSMUST00000110115 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
ScocQ78YZ6 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
ScocQ78YZ6 Akap12-201ENSMUST00000045730 6195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
ScocQ78YZ6 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
ScocQ78YZ6 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
ScocQ78YZ6 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
ScocQ78YZ6 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
ScocQ78YZ6 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
ScocQ78YZ6 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
ScocQ78YZ6 Myh1-201ENSMUST00000018637 5938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
ScocQ78YZ6 Kif1a-203ENSMUST00000171556 5391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
ScocQ78YZ6 Nphs1-201ENSMUST00000006825 4608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
ScocQ78YZ6 Mob3b-201ENSMUST00000102975 6030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
ScocQ78YZ6 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
ScocQ78YZ6 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
ScocQ78YZ6 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
ScocQ78YZ6 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
ScocQ78YZ6 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
ScocQ78YZ6 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
ScocQ78YZ6 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
ScocQ78YZ6 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
ScocQ78YZ6 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
ScocQ78YZ6 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
ScocQ78YZ6 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
ScocQ78YZ6 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
ScocQ78YZ6 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
ScocQ78YZ6 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
ScocQ78YZ6 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
ScocQ78YZ6 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
ScocQ78YZ6 Grin2b-202ENSMUST00000111905 7484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
ScocQ78YZ6 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
ScocQ78YZ6 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
ScocQ78YZ6 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
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