Protein–RNA interactions for Protein: Q78JW9

Ubfd1, Ubiquitin domain-containing protein UBFD1, mousemouse

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubfd1Q78JW9 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ubfd1Q78JW9 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ubfd1Q78JW9 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ubfd1Q78JW9 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Ubfd1Q78JW9 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ubfd1Q78JW9 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ubfd1Q78JW9 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ubfd1Q78JW9 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Ubfd1Q78JW9 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ubfd1Q78JW9 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ubfd1Q78JW9 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ubfd1Q78JW9 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ubfd1Q78JW9 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ubfd1Q78JW9 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ubfd1Q78JW9 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ubfd1Q78JW9 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ubfd1Q78JW9 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ubfd1Q78JW9 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ubfd1Q78JW9 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ubfd1Q78JW9 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ubfd1Q78JW9 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ubfd1Q78JW9 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ubfd1Q78JW9 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ubfd1Q78JW9 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ubfd1Q78JW9 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Ubfd1Q78JW9 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Ubfd1Q78JW9 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ubfd1Q78JW9 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Ubfd1Q78JW9 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Ubfd1Q78JW9 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ubfd1Q78JW9 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ubfd1Q78JW9 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ubfd1Q78JW9 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ubfd1Q78JW9 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ubfd1Q78JW9 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ubfd1Q78JW9 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ubfd1Q78JW9 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ubfd1Q78JW9 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ubfd1Q78JW9 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ubfd1Q78JW9 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ubfd1Q78JW9 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ubfd1Q78JW9 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ubfd1Q78JW9 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ubfd1Q78JW9 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ubfd1Q78JW9 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ubfd1Q78JW9 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ubfd1Q78JW9 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ubfd1Q78JW9 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ubfd1Q78JW9 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Ubfd1Q78JW9 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ubfd1Q78JW9 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ubfd1Q78JW9 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Ubfd1Q78JW9 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ubfd1Q78JW9 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ubfd1Q78JW9 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Ubfd1Q78JW9 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ubfd1Q78JW9 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ubfd1Q78JW9 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ubfd1Q78JW9 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ubfd1Q78JW9 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Ubfd1Q78JW9 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ubfd1Q78JW9 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
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Ubfd1Q78JW9 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ubfd1Q78JW9 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ubfd1Q78JW9 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
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Ubfd1Q78JW9 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ubfd1Q78JW9 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ubfd1Q78JW9 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ubfd1Q78JW9 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ubfd1Q78JW9 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ubfd1Q78JW9 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ubfd1Q78JW9 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ubfd1Q78JW9 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ubfd1Q78JW9 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ubfd1Q78JW9 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ubfd1Q78JW9 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ubfd1Q78JW9 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ubfd1Q78JW9 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ubfd1Q78JW9 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ubfd1Q78JW9 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ubfd1Q78JW9 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ubfd1Q78JW9 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ubfd1Q78JW9 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.35
Ubfd1Q78JW9 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Ubfd1Q78JW9 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC12.83□□□□□ -0.35
Ubfd1Q78JW9 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Ubfd1Q78JW9 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
Ubfd1Q78JW9 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Ubfd1Q78JW9 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Ubfd1Q78JW9 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Ubfd1Q78JW9 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
Ubfd1Q78JW9 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ubfd1Q78JW9 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ubfd1Q78JW9 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Ubfd1Q78JW9 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
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