Protein–RNA interactions for Protein: Q715T0

Nme8, Thioredoxin domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme8Q715T0 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nme8Q715T0 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nme8Q715T0 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Nme8Q715T0 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nme8Q715T0 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nme8Q715T0 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nme8Q715T0 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nme8Q715T0 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Nme8Q715T0 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Nme8Q715T0 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nme8Q715T0 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Nme8Q715T0 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nme8Q715T0 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nme8Q715T0 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nme8Q715T0 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nme8Q715T0 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nme8Q715T0 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nme8Q715T0 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nme8Q715T0 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nme8Q715T0 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nme8Q715T0 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nme8Q715T0 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nme8Q715T0 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nme8Q715T0 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Nme8Q715T0 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nme8Q715T0 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nme8Q715T0 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nme8Q715T0 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nme8Q715T0 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nme8Q715T0 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nme8Q715T0 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nme8Q715T0 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nme8Q715T0 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nme8Q715T0 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nme8Q715T0 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nme8Q715T0 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nme8Q715T0 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nme8Q715T0 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nme8Q715T0 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Nme8Q715T0 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Nme8Q715T0 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nme8Q715T0 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nme8Q715T0 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nme8Q715T0 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nme8Q715T0 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nme8Q715T0 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nme8Q715T0 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Nme8Q715T0 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nme8Q715T0 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Nme8Q715T0 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nme8Q715T0 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Nme8Q715T0 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Nme8Q715T0 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Nme8Q715T0 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nme8Q715T0 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nme8Q715T0 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nme8Q715T0 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nme8Q715T0 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nme8Q715T0 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nme8Q715T0 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nme8Q715T0 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nme8Q715T0 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nme8Q715T0 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nme8Q715T0 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nme8Q715T0 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nme8Q715T0 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nme8Q715T0 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nme8Q715T0 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nme8Q715T0 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Nme8Q715T0 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nme8Q715T0 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nme8Q715T0 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nme8Q715T0 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nme8Q715T0 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nme8Q715T0 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nme8Q715T0 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nme8Q715T0 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nme8Q715T0 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nme8Q715T0 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nme8Q715T0 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nme8Q715T0 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nme8Q715T0 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nme8Q715T0 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nme8Q715T0 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nme8Q715T0 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nme8Q715T0 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nme8Q715T0 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nme8Q715T0 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nme8Q715T0 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nme8Q715T0 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Nme8Q715T0 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nme8Q715T0 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nme8Q715T0 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nme8Q715T0 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nme8Q715T0 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nme8Q715T0 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nme8Q715T0 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nme8Q715T0 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nme8Q715T0 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nme8Q715T0 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms