Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWS4

Cnih3, Protein cornichon homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnih3Q6ZWS4 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cnih3Q6ZWS4 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cnih3Q6ZWS4 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cnih3Q6ZWS4 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cnih3Q6ZWS4 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cnih3Q6ZWS4 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cnih3Q6ZWS4 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cnih3Q6ZWS4 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Cnih3Q6ZWS4 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cnih3Q6ZWS4 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cnih3Q6ZWS4 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cnih3Q6ZWS4 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Cnih3Q6ZWS4 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cnih3Q6ZWS4 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cnih3Q6ZWS4 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cnih3Q6ZWS4 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cnih3Q6ZWS4 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cnih3Q6ZWS4 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cnih3Q6ZWS4 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cnih3Q6ZWS4 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cnih3Q6ZWS4 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cnih3Q6ZWS4 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cnih3Q6ZWS4 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cnih3Q6ZWS4 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cnih3Q6ZWS4 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cnih3Q6ZWS4 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cnih3Q6ZWS4 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cnih3Q6ZWS4 Arntl-206ENSMUST00000211770 2464 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cnih3Q6ZWS4 Spata33-202ENSMUST00000212161 2941 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cnih3Q6ZWS4 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cnih3Q6ZWS4 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Cnih3Q6ZWS4 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cnih3Q6ZWS4 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cnih3Q6ZWS4 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cnih3Q6ZWS4 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cnih3Q6ZWS4 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Cnih3Q6ZWS4 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cnih3Q6ZWS4 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Cnih3Q6ZWS4 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cnih3Q6ZWS4 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cnih3Q6ZWS4 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Cnih3Q6ZWS4 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cnih3Q6ZWS4 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cnih3Q6ZWS4 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cnih3Q6ZWS4 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cnih3Q6ZWS4 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cnih3Q6ZWS4 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cnih3Q6ZWS4 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cnih3Q6ZWS4 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cnih3Q6ZWS4 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cnih3Q6ZWS4 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Cnih3Q6ZWS4 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Cnih3Q6ZWS4 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cnih3Q6ZWS4 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cnih3Q6ZWS4 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cnih3Q6ZWS4 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Cnih3Q6ZWS4 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Cnih3Q6ZWS4 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Cnih3Q6ZWS4 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cnih3Q6ZWS4 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Cnih3Q6ZWS4 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cnih3Q6ZWS4 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cnih3Q6ZWS4 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cnih3Q6ZWS4 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cnih3Q6ZWS4 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cnih3Q6ZWS4 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cnih3Q6ZWS4 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cnih3Q6ZWS4 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cnih3Q6ZWS4 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cnih3Q6ZWS4 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cnih3Q6ZWS4 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cnih3Q6ZWS4 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cnih3Q6ZWS4 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cnih3Q6ZWS4 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cnih3Q6ZWS4 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cnih3Q6ZWS4 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Cnih3Q6ZWS4 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cnih3Q6ZWS4 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cnih3Q6ZWS4 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cnih3Q6ZWS4 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cnih3Q6ZWS4 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cnih3Q6ZWS4 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cnih3Q6ZWS4 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cnih3Q6ZWS4 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cnih3Q6ZWS4 Cadm1-203ENSMUST00000114547 4444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cnih3Q6ZWS4 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cnih3Q6ZWS4 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cnih3Q6ZWS4 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cnih3Q6ZWS4 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cnih3Q6ZWS4 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cnih3Q6ZWS4 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cnih3Q6ZWS4 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Cnih3Q6ZWS4 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cnih3Q6ZWS4 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cnih3Q6ZWS4 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Cnih3Q6ZWS4 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Cnih3Q6ZWS4 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cnih3Q6ZWS4 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cnih3Q6ZWS4 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cnih3Q6ZWS4 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.6 ms