Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQF0

Topbp1, DNA topoisomerase 2-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Topbp1Q6ZQF0 Gm13010-201ENSMUST00000140495 828 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Topbp1Q6ZQF0 Gm28727-201ENSMUST00000176549 443 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Topbp1Q6ZQF0 Nr1h2-ps-201ENSMUST00000183844 478 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Topbp1Q6ZQF0 Gm43830-201ENSMUST00000198760 1067 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Topbp1Q6ZQF0 Gm10069-203ENSMUST00000204081 907 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Topbp1Q6ZQF0 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Topbp1Q6ZQF0 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Topbp1Q6ZQF0 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Topbp1Q6ZQF0 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Topbp1Q6ZQF0 Zfp957-202ENSMUST00000161649 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Topbp1Q6ZQF0 Gm21998-201ENSMUST00000117552 1308 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Topbp1Q6ZQF0 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Topbp1Q6ZQF0 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Topbp1Q6ZQF0 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Topbp1Q6ZQF0 Got1l1-201ENSMUST00000038174 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Topbp1Q6ZQF0 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Topbp1Q6ZQF0 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Topbp1Q6ZQF0 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Topbp1Q6ZQF0 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Topbp1Q6ZQF0 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Topbp1Q6ZQF0 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Topbp1Q6ZQF0 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Topbp1Q6ZQF0 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Topbp1Q6ZQF0 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Topbp1Q6ZQF0 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Topbp1Q6ZQF0 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Topbp1Q6ZQF0 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Topbp1Q6ZQF0 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Topbp1Q6ZQF0 Cstad-201ENSMUST00000102853 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Topbp1Q6ZQF0 Tnnt3-206ENSMUST00000105944 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Topbp1Q6ZQF0 Tnnt3-210ENSMUST00000105948 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Topbp1Q6ZQF0 Tnnt3-212ENSMUST00000105950 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Topbp1Q6ZQF0 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Topbp1Q6ZQF0 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Topbp1Q6ZQF0 Prdx5-203ENSMUST00000149261 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Topbp1Q6ZQF0 Tnnt3-224ENSMUST00000169299 1013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Topbp1Q6ZQF0 Chtf8-203ENSMUST00000176090 615 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Topbp1Q6ZQF0 Tnnt3-226ENSMUST00000180152 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Topbp1Q6ZQF0 Gm13522-202ENSMUST00000209682 997 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Topbp1Q6ZQF0 Trappc4-206ENSMUST00000217163 1185 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Topbp1Q6ZQF0 Fam151b-201ENSMUST00000040106 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Topbp1Q6ZQF0 Ginm1-202ENSMUST00000065124 300 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Topbp1Q6ZQF0 Gm11555-201ENSMUST00000073126 492 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Topbp1Q6ZQF0 Ifi27-205ENSMUST00000085065 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Topbp1Q6ZQF0 Rsg1-201ENSMUST00000097813 985 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Topbp1Q6ZQF0 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Topbp1Q6ZQF0 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Topbp1Q6ZQF0 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Topbp1Q6ZQF0 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Topbp1Q6ZQF0 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Topbp1Q6ZQF0 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Topbp1Q6ZQF0 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Topbp1Q6ZQF0 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Topbp1Q6ZQF0 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Topbp1Q6ZQF0 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Topbp1Q6ZQF0 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Topbp1Q6ZQF0 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Topbp1Q6ZQF0 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Topbp1Q6ZQF0 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Topbp1Q6ZQF0 Gm22133-201ENSMUST00000102082 109 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Topbp1Q6ZQF0 Timm10b-204ENSMUST00000106784 494 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Topbp1Q6ZQF0 Skap1-206ENSMUST00000107663 742 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Topbp1Q6ZQF0 Gm12298-201ENSMUST00000126999 731 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Topbp1Q6ZQF0 Tbc1d22bos-201ENSMUST00000159875 826 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Topbp1Q6ZQF0 1110008E08Rik-202ENSMUST00000183621 723 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Topbp1Q6ZQF0 1700030I03Rik-201ENSMUST00000192978 942 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Topbp1Q6ZQF0 Gm7600-201ENSMUST00000209657 785 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Topbp1Q6ZQF0 Gm1821-202ENSMUST00000227415 750 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Topbp1Q6ZQF0 Lcn8-201ENSMUST00000038482 651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Topbp1Q6ZQF0 Cmtm2b-201ENSMUST00000041973 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Topbp1Q6ZQF0 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Topbp1Q6ZQF0 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Topbp1Q6ZQF0 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Topbp1Q6ZQF0 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Topbp1Q6ZQF0 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Topbp1Q6ZQF0 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Topbp1Q6ZQF0 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Topbp1Q6ZQF0 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Topbp1Q6ZQF0 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Topbp1Q6ZQF0 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Topbp1Q6ZQF0 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Topbp1Q6ZQF0 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Topbp1Q6ZQF0 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Topbp1Q6ZQF0 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Topbp1Q6ZQF0 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Topbp1Q6ZQF0 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Topbp1Q6ZQF0 Gm3830-201ENSMUST00000185540 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Topbp1Q6ZQF0 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Topbp1Q6ZQF0 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Topbp1Q6ZQF0 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Topbp1Q6ZQF0 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Topbp1Q6ZQF0 Asb8-202ENSMUST00000123626 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Topbp1Q6ZQF0 Asb8-203ENSMUST00000123922 1162 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Topbp1Q6ZQF0 Gm16740-201ENSMUST00000181819 956 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Topbp1Q6ZQF0 AC129219.2-201ENSMUST00000224324 701 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Topbp1Q6ZQF0 Mrpl30-201ENSMUST00000027256 969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Topbp1Q6ZQF0 Gm5455-201ENSMUST00000058710 715 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Topbp1Q6ZQF0 Hmgb1-202ENSMUST00000093196 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Topbp1Q6ZQF0 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Topbp1Q6ZQF0 Adh4-201ENSMUST00000013458 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms