Protein–RNA interactions for Protein: Q6VGS5

Ccdc88c, Protein Daple, mousemouse

Predictions only

Length 2,009 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc88cQ6VGS5 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc88cQ6VGS5 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc88cQ6VGS5 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc88cQ6VGS5 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc88cQ6VGS5 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc88cQ6VGS5 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc88cQ6VGS5 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc88cQ6VGS5 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc88cQ6VGS5 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc88cQ6VGS5 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc88cQ6VGS5 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc88cQ6VGS5 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc88cQ6VGS5 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc88cQ6VGS5 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc88cQ6VGS5 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc88cQ6VGS5 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc88cQ6VGS5 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc88cQ6VGS5 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc88cQ6VGS5 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc88cQ6VGS5 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc88cQ6VGS5 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc88cQ6VGS5 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc88cQ6VGS5 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc88cQ6VGS5 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc88cQ6VGS5 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc88cQ6VGS5 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc88cQ6VGS5 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc88cQ6VGS5 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc88cQ6VGS5 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc88cQ6VGS5 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc88cQ6VGS5 Gm38341-201ENSMUST00000195357 515 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc88cQ6VGS5 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc88cQ6VGS5 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc88cQ6VGS5 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc88cQ6VGS5 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc88cQ6VGS5 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc88cQ6VGS5 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc88cQ6VGS5 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc88cQ6VGS5 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc88cQ6VGS5 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc88cQ6VGS5 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc88cQ6VGS5 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc88cQ6VGS5 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc88cQ6VGS5 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc88cQ6VGS5 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc88cQ6VGS5 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc88cQ6VGS5 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc88cQ6VGS5 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc88cQ6VGS5 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc88cQ6VGS5 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc88cQ6VGS5 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc88cQ6VGS5 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc88cQ6VGS5 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc88cQ6VGS5 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc88cQ6VGS5 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc88cQ6VGS5 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc88cQ6VGS5 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc88cQ6VGS5 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc88cQ6VGS5 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc88cQ6VGS5 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc88cQ6VGS5 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc88cQ6VGS5 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc88cQ6VGS5 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc88cQ6VGS5 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc88cQ6VGS5 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc88cQ6VGS5 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc88cQ6VGS5 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc88cQ6VGS5 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc88cQ6VGS5 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc88cQ6VGS5 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc88cQ6VGS5 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc88cQ6VGS5 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc88cQ6VGS5 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc88cQ6VGS5 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc88cQ6VGS5 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc88cQ6VGS5 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc88cQ6VGS5 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc88cQ6VGS5 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc88cQ6VGS5 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc88cQ6VGS5 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc88cQ6VGS5 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc88cQ6VGS5 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc88cQ6VGS5 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc88cQ6VGS5 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc88cQ6VGS5 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc88cQ6VGS5 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc88cQ6VGS5 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc88cQ6VGS5 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc88cQ6VGS5 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc88cQ6VGS5 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc88cQ6VGS5 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc88cQ6VGS5 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc88cQ6VGS5 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc88cQ6VGS5 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc88cQ6VGS5 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc88cQ6VGS5 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc88cQ6VGS5 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc88cQ6VGS5 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc88cQ6VGS5 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms