Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCX9

Trim37, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM37, mousemouse

Predictions only

Length 961 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim37Q6PCX9 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim37Q6PCX9 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim37Q6PCX9 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim37Q6PCX9 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim37Q6PCX9 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim37Q6PCX9 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim37Q6PCX9 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim37Q6PCX9 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim37Q6PCX9 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim37Q6PCX9 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim37Q6PCX9 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim37Q6PCX9 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim37Q6PCX9 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim37Q6PCX9 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim37Q6PCX9 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim37Q6PCX9 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim37Q6PCX9 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim37Q6PCX9 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim37Q6PCX9 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim37Q6PCX9 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim37Q6PCX9 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim37Q6PCX9 Wsb2-ps-201ENSMUST00000117937 1217 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim37Q6PCX9 Gm14263-201ENSMUST00000117955 746 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim37Q6PCX9 Gm4819-201ENSMUST00000182170 1009 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim37Q6PCX9 Gm37986-201ENSMUST00000193285 383 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim37Q6PCX9 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim37Q6PCX9 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim37Q6PCX9 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim37Q6PCX9 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim37Q6PCX9 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim37Q6PCX9 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim37Q6PCX9 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim37Q6PCX9 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim37Q6PCX9 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim37Q6PCX9 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim37Q6PCX9 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim37Q6PCX9 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim37Q6PCX9 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim37Q6PCX9 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim37Q6PCX9 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim37Q6PCX9 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim37Q6PCX9 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim37Q6PCX9 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim37Q6PCX9 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim37Q6PCX9 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim37Q6PCX9 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim37Q6PCX9 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim37Q6PCX9 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim37Q6PCX9 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim37Q6PCX9 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim37Q6PCX9 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim37Q6PCX9 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim37Q6PCX9 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim37Q6PCX9 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim37Q6PCX9 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim37Q6PCX9 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim37Q6PCX9 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim37Q6PCX9 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim37Q6PCX9 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim37Q6PCX9 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim37Q6PCX9 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim37Q6PCX9 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim37Q6PCX9 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim37Q6PCX9 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim37Q6PCX9 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim37Q6PCX9 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim37Q6PCX9 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trim37Q6PCX9 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trim37Q6PCX9 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trim37Q6PCX9 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trim37Q6PCX9 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trim37Q6PCX9 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trim37Q6PCX9 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trim37Q6PCX9 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trim37Q6PCX9 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trim37Q6PCX9 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trim37Q6PCX9 1810043G02Rik-202ENSMUST00000105398 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trim37Q6PCX9 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trim37Q6PCX9 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Trim37Q6PCX9 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Trim37Q6PCX9 Gm24514-201ENSMUST00000174961 285 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Trim37Q6PCX9 1700034G24Rik-202ENSMUST00000183186 1081 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trim37Q6PCX9 Mir6979-201ENSMUST00000183927 56 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Trim37Q6PCX9 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trim37Q6PCX9 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Trim37Q6PCX9 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trim37Q6PCX9 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trim37Q6PCX9 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trim37Q6PCX9 Gm9843-201ENSMUST00000052867 504 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trim37Q6PCX9 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trim37Q6PCX9 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trim37Q6PCX9 Add2-203ENSMUST00000203279 1454 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trim37Q6PCX9 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trim37Q6PCX9 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trim37Q6PCX9 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trim37Q6PCX9 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trim37Q6PCX9 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trim37Q6PCX9 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trim37Q6PCX9 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trim37Q6PCX9 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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