Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9L4

Usp49, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 49, mousemouse

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Length 685 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp49Q6P9L4 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Usp49Q6P9L4 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Usp49Q6P9L4 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Usp49Q6P9L4 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Usp49Q6P9L4 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Usp49Q6P9L4 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Usp49Q6P9L4 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Usp49Q6P9L4 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Usp49Q6P9L4 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Usp49Q6P9L4 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Usp49Q6P9L4 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Usp49Q6P9L4 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Usp49Q6P9L4 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Usp49Q6P9L4 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Usp49Q6P9L4 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Usp49Q6P9L4 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Usp49Q6P9L4 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Usp49Q6P9L4 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Usp49Q6P9L4 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Usp49Q6P9L4 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Usp49Q6P9L4 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Usp49Q6P9L4 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Usp49Q6P9L4 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Usp49Q6P9L4 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Usp49Q6P9L4 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Usp49Q6P9L4 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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Usp49Q6P9L4 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Usp49Q6P9L4 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Usp49Q6P9L4 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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Usp49Q6P9L4 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Usp49Q6P9L4 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Usp49Q6P9L4 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Usp49Q6P9L4 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
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Usp49Q6P9L4 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Usp49Q6P9L4 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Usp49Q6P9L4 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Usp49Q6P9L4 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
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Usp49Q6P9L4 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Usp49Q6P9L4 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Usp49Q6P9L4 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
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Usp49Q6P9L4 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
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Usp49Q6P9L4 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Usp49Q6P9L4 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Usp49Q6P9L4 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Usp49Q6P9L4 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
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Usp49Q6P9L4 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Usp49Q6P9L4 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Usp49Q6P9L4 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
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Usp49Q6P9L4 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Usp49Q6P9L4 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
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Usp49Q6P9L4 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Usp49Q6P9L4 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Usp49Q6P9L4 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Usp49Q6P9L4 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Usp49Q6P9L4 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Usp49Q6P9L4 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Usp49Q6P9L4 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Usp49Q6P9L4 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Usp49Q6P9L4 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Usp49Q6P9L4 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp49Q6P9L4 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp49Q6P9L4 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp49Q6P9L4 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp49Q6P9L4 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp49Q6P9L4 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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