Protein–RNA interactions for Protein: Q6IUP1

Sohlh1, Spermatogenesis- and oogenesis-specific basic helix-loop-helix-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 357 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sohlh1Q6IUP1 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Sohlh1Q6IUP1 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Sohlh1Q6IUP1 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Sohlh1Q6IUP1 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Sohlh1Q6IUP1 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Sohlh1Q6IUP1 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Sohlh1Q6IUP1 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sohlh1Q6IUP1 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sohlh1Q6IUP1 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sohlh1Q6IUP1 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sohlh1Q6IUP1 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sohlh1Q6IUP1 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sohlh1Q6IUP1 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sohlh1Q6IUP1 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Sohlh1Q6IUP1 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sohlh1Q6IUP1 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sohlh1Q6IUP1 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sohlh1Q6IUP1 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sohlh1Q6IUP1 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sohlh1Q6IUP1 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sohlh1Q6IUP1 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Sohlh1Q6IUP1 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sohlh1Q6IUP1 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Sohlh1Q6IUP1 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Sohlh1Q6IUP1 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sohlh1Q6IUP1 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sohlh1Q6IUP1 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sohlh1Q6IUP1 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sohlh1Q6IUP1 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sohlh1Q6IUP1 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sohlh1Q6IUP1 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sohlh1Q6IUP1 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sohlh1Q6IUP1 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sohlh1Q6IUP1 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sohlh1Q6IUP1 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sohlh1Q6IUP1 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sohlh1Q6IUP1 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sohlh1Q6IUP1 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sohlh1Q6IUP1 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sohlh1Q6IUP1 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sohlh1Q6IUP1 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sohlh1Q6IUP1 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sohlh1Q6IUP1 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sohlh1Q6IUP1 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sohlh1Q6IUP1 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sohlh1Q6IUP1 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sohlh1Q6IUP1 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sohlh1Q6IUP1 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sohlh1Q6IUP1 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sohlh1Q6IUP1 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sohlh1Q6IUP1 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sohlh1Q6IUP1 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sohlh1Q6IUP1 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sohlh1Q6IUP1 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sohlh1Q6IUP1 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sohlh1Q6IUP1 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sohlh1Q6IUP1 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sohlh1Q6IUP1 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sohlh1Q6IUP1 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sohlh1Q6IUP1 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sohlh1Q6IUP1 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sohlh1Q6IUP1 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Sohlh1Q6IUP1 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sohlh1Q6IUP1 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sohlh1Q6IUP1 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sohlh1Q6IUP1 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sohlh1Q6IUP1 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sohlh1Q6IUP1 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sohlh1Q6IUP1 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sohlh1Q6IUP1 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sohlh1Q6IUP1 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sohlh1Q6IUP1 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sohlh1Q6IUP1 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sohlh1Q6IUP1 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sohlh1Q6IUP1 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sohlh1Q6IUP1 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sohlh1Q6IUP1 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sohlh1Q6IUP1 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sohlh1Q6IUP1 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Sohlh1Q6IUP1 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sohlh1Q6IUP1 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sohlh1Q6IUP1 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sohlh1Q6IUP1 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sohlh1Q6IUP1 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sohlh1Q6IUP1 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Sohlh1Q6IUP1 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Sohlh1Q6IUP1 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC12.83□□□□□ -0.35
Sohlh1Q6IUP1 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Sohlh1Q6IUP1 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Sohlh1Q6IUP1 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Sohlh1Q6IUP1 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Sohlh1Q6IUP1 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Sohlh1Q6IUP1 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Sohlh1Q6IUP1 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Sohlh1Q6IUP1 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Sohlh1Q6IUP1 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Sohlh1Q6IUP1 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Sohlh1Q6IUP1 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Sohlh1Q6IUP1 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Sohlh1Q6IUP1 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.7 ms