Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRU5

Cltb, Clathrin light chain B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 229 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CltbQ6IRU5 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
CltbQ6IRU5 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
CltbQ6IRU5 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
CltbQ6IRU5 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
CltbQ6IRU5 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
CltbQ6IRU5 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
CltbQ6IRU5 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.18□□□□□ -0.46
CltbQ6IRU5 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
CltbQ6IRU5 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
CltbQ6IRU5 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
CltbQ6IRU5 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
CltbQ6IRU5 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
CltbQ6IRU5 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
CltbQ6IRU5 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC12.18□□□□□ -0.46
CltbQ6IRU5 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
CltbQ6IRU5 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
CltbQ6IRU5 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
CltbQ6IRU5 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC12.18□□□□□ -0.46
CltbQ6IRU5 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
CltbQ6IRU5 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
CltbQ6IRU5 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
CltbQ6IRU5 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
CltbQ6IRU5 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
CltbQ6IRU5 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
CltbQ6IRU5 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
CltbQ6IRU5 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
CltbQ6IRU5 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
CltbQ6IRU5 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
CltbQ6IRU5 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
CltbQ6IRU5 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
CltbQ6IRU5 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
CltbQ6IRU5 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
CltbQ6IRU5 Kndc1-201ENSMUST00000053445 7299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
CltbQ6IRU5 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
CltbQ6IRU5 Myo18a-210ENSMUST00000130305 5450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
CltbQ6IRU5 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
CltbQ6IRU5 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
CltbQ6IRU5 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
CltbQ6IRU5 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
CltbQ6IRU5 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
CltbQ6IRU5 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
CltbQ6IRU5 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
CltbQ6IRU5 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
CltbQ6IRU5 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
CltbQ6IRU5 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
CltbQ6IRU5 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
CltbQ6IRU5 Pik3cd-206ENSMUST00000122059 4832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
CltbQ6IRU5 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
CltbQ6IRU5 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
CltbQ6IRU5 Dlg4-203ENSMUST00000108588 3457 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
CltbQ6IRU5 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
CltbQ6IRU5 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.17□□□□□ -0.46
CltbQ6IRU5 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
CltbQ6IRU5 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
CltbQ6IRU5 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
CltbQ6IRU5 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
CltbQ6IRU5 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC12.17□□□□□ -0.46
CltbQ6IRU5 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
CltbQ6IRU5 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
CltbQ6IRU5 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
CltbQ6IRU5 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.17□□□□□ -0.46
CltbQ6IRU5 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC12.17□□□□□ -0.46
CltbQ6IRU5 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
CltbQ6IRU5 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
CltbQ6IRU5 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC12.17□□□□□ -0.46
CltbQ6IRU5 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
CltbQ6IRU5 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
CltbQ6IRU5 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
CltbQ6IRU5 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
CltbQ6IRU5 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
CltbQ6IRU5 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
CltbQ6IRU5 Cacna1c-203ENSMUST00000112790 7631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
CltbQ6IRU5 Dysf-212ENSMUST00000203695 6504 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
CltbQ6IRU5 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
CltbQ6IRU5 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
CltbQ6IRU5 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
CltbQ6IRU5 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
CltbQ6IRU5 Cul9-204ENSMUST00000182485 7848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
CltbQ6IRU5 Duox2-201ENSMUST00000053734 5744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
CltbQ6IRU5 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
CltbQ6IRU5 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC12.17□□□□□ -0.46
CltbQ6IRU5 Pbx1-205ENSMUST00000176540 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
CltbQ6IRU5 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
CltbQ6IRU5 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
CltbQ6IRU5 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
CltbQ6IRU5 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
CltbQ6IRU5 Adprhl1-205ENSMUST00000204916 5228 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
CltbQ6IRU5 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
CltbQ6IRU5 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
CltbQ6IRU5 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
CltbQ6IRU5 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
CltbQ6IRU5 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
CltbQ6IRU5 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
CltbQ6IRU5 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
CltbQ6IRU5 Zbtb44-201ENSMUST00000115222 8861 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
CltbQ6IRU5 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
CltbQ6IRU5 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
CltbQ6IRU5 Snx33-201ENSMUST00000050916 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
CltbQ6IRU5 Gpr26-201ENSMUST00000045840 11571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
CltbQ6IRU5 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.6 ms