Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFT4

Arhgap20, Rho GTPase-activating protein 20, mousemouse

Predictions only

Length 1,182 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arhgap20Q6IFT4 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Arhgap20Q6IFT4 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Arhgap20Q6IFT4 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Arhgap20Q6IFT4 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Arhgap20Q6IFT4 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Arhgap20Q6IFT4 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Arhgap20Q6IFT4 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Arhgap20Q6IFT4 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Arhgap20Q6IFT4 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Arhgap20Q6IFT4 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Arhgap20Q6IFT4 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Arhgap20Q6IFT4 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Arhgap20Q6IFT4 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Arhgap20Q6IFT4 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Arhgap20Q6IFT4 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Arhgap20Q6IFT4 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Arhgap20Q6IFT4 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Arhgap20Q6IFT4 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Arhgap20Q6IFT4 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Arhgap20Q6IFT4 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Arhgap20Q6IFT4 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Arhgap20Q6IFT4 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Arhgap20Q6IFT4 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Arhgap20Q6IFT4 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Arhgap20Q6IFT4 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Arhgap20Q6IFT4 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Arhgap20Q6IFT4 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Arhgap20Q6IFT4 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Arhgap20Q6IFT4 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Arhgap20Q6IFT4 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Arhgap20Q6IFT4 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Arhgap20Q6IFT4 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Arhgap20Q6IFT4 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Arhgap20Q6IFT4 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Arhgap20Q6IFT4 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Arhgap20Q6IFT4 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Arhgap20Q6IFT4 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Arhgap20Q6IFT4 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Arhgap20Q6IFT4 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Arhgap20Q6IFT4 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Arhgap20Q6IFT4 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Arhgap20Q6IFT4 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Arhgap20Q6IFT4 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Arhgap20Q6IFT4 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Arhgap20Q6IFT4 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Arhgap20Q6IFT4 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Arhgap20Q6IFT4 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Arhgap20Q6IFT4 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Arhgap20Q6IFT4 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Arhgap20Q6IFT4 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Arhgap20Q6IFT4 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Arhgap20Q6IFT4 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Arhgap20Q6IFT4 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Arhgap20Q6IFT4 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Arhgap20Q6IFT4 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Arhgap20Q6IFT4 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Arhgap20Q6IFT4 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Arhgap20Q6IFT4 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Arhgap20Q6IFT4 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Arhgap20Q6IFT4 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Arhgap20Q6IFT4 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Arhgap20Q6IFT4 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Arhgap20Q6IFT4 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Arhgap20Q6IFT4 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Arhgap20Q6IFT4 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Arhgap20Q6IFT4 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Arhgap20Q6IFT4 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Arhgap20Q6IFT4 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Arhgap20Q6IFT4 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Arhgap20Q6IFT4 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Arhgap20Q6IFT4 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Arhgap20Q6IFT4 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Arhgap20Q6IFT4 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Arhgap20Q6IFT4 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Arhgap20Q6IFT4 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Arhgap20Q6IFT4 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Arhgap20Q6IFT4 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Arhgap20Q6IFT4 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Arhgap20Q6IFT4 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Arhgap20Q6IFT4 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Arhgap20Q6IFT4 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Arhgap20Q6IFT4 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Arhgap20Q6IFT4 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Arhgap20Q6IFT4 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Arhgap20Q6IFT4 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Arhgap20Q6IFT4 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Arhgap20Q6IFT4 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Arhgap20Q6IFT4 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Arhgap20Q6IFT4 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Arhgap20Q6IFT4 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Arhgap20Q6IFT4 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Arhgap20Q6IFT4 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Arhgap20Q6IFT4 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Arhgap20Q6IFT4 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Arhgap20Q6IFT4 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Arhgap20Q6IFT4 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Arhgap20Q6IFT4 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Arhgap20Q6IFT4 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Arhgap20Q6IFT4 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Arhgap20Q6IFT4 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms