Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFW4

Nop58, Nucleolar protein 58, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 536 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop58Q6DFW4 Grin1-207ENSMUST00000114317 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nop58Q6DFW4 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nop58Q6DFW4 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nop58Q6DFW4 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nop58Q6DFW4 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nop58Q6DFW4 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nop58Q6DFW4 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nop58Q6DFW4 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nop58Q6DFW4 Mgat1-203ENSMUST00000109194 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nop58Q6DFW4 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nop58Q6DFW4 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nop58Q6DFW4 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nop58Q6DFW4 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nop58Q6DFW4 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Nop58Q6DFW4 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nop58Q6DFW4 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Nop58Q6DFW4 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Nop58Q6DFW4 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nop58Q6DFW4 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nop58Q6DFW4 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nop58Q6DFW4 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nop58Q6DFW4 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nop58Q6DFW4 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nop58Q6DFW4 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nop58Q6DFW4 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nop58Q6DFW4 Fam234b-202ENSMUST00000111916 2927 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nop58Q6DFW4 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nop58Q6DFW4 Rab10os-203ENSMUST00000178074 4006 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nop58Q6DFW4 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nop58Q6DFW4 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nop58Q6DFW4 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nop58Q6DFW4 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nop58Q6DFW4 Ercc2-202ENSMUST00000108460 3485 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nop58Q6DFW4 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nop58Q6DFW4 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nop58Q6DFW4 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nop58Q6DFW4 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Nop58Q6DFW4 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nop58Q6DFW4 Tinf2-201ENSMUST00000007733 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nop58Q6DFW4 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nop58Q6DFW4 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nop58Q6DFW4 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nop58Q6DFW4 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nop58Q6DFW4 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nop58Q6DFW4 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nop58Q6DFW4 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nop58Q6DFW4 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nop58Q6DFW4 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nop58Q6DFW4 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nop58Q6DFW4 Eogt-201ENSMUST00000054344 4424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nop58Q6DFW4 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nop58Q6DFW4 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Nop58Q6DFW4 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Nop58Q6DFW4 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Nop58Q6DFW4 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Nop58Q6DFW4 Eps15l1-201ENSMUST00000163643 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Nop58Q6DFW4 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nop58Q6DFW4 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nop58Q6DFW4 Dnajc12-201ENSMUST00000043317 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nop58Q6DFW4 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nop58Q6DFW4 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nop58Q6DFW4 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nop58Q6DFW4 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nop58Q6DFW4 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Nop58Q6DFW4 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Nop58Q6DFW4 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nop58Q6DFW4 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nop58Q6DFW4 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nop58Q6DFW4 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nop58Q6DFW4 Gm5936-201ENSMUST00000114116 2857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nop58Q6DFW4 Gm5640-201ENSMUST00000114119 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nop58Q6DFW4 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nop58Q6DFW4 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nop58Q6DFW4 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nop58Q6DFW4 Olfr648-202ENSMUST00000216612 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nop58Q6DFW4 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nop58Q6DFW4 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nop58Q6DFW4 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nop58Q6DFW4 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nop58Q6DFW4 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nop58Q6DFW4 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nop58Q6DFW4 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nop58Q6DFW4 Gm45833-201ENSMUST00000211931 2730 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nop58Q6DFW4 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nop58Q6DFW4 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nop58Q6DFW4 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nop58Q6DFW4 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nop58Q6DFW4 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nop58Q6DFW4 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nop58Q6DFW4 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nop58Q6DFW4 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nop58Q6DFW4 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nop58Q6DFW4 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nop58Q6DFW4 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nop58Q6DFW4 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nop58Q6DFW4 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Nop58Q6DFW4 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Nop58Q6DFW4 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nop58Q6DFW4 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nop58Q6DFW4 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.8 ms