Protein–RNA interactions for Protein: Q68FH0

Pkp4, Plakophilin-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,190 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp4Q68FH0 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
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Pkp4Q68FH0 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Pkp4Q68FH0 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Pkp4Q68FH0 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
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Pkp4Q68FH0 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Pkp4Q68FH0 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
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Pkp4Q68FH0 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Pkp4Q68FH0 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Pkp4Q68FH0 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Pkp4Q68FH0 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
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Pkp4Q68FH0 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Pkp4Q68FH0 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Pkp4Q68FH0 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Pkp4Q68FH0 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Pkp4Q68FH0 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
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Pkp4Q68FH0 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Pkp4Q68FH0 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
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Pkp4Q68FH0 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Pkp4Q68FH0 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
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Pkp4Q68FH0 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Pkp4Q68FH0 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
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Pkp4Q68FH0 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
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Pkp4Q68FH0 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
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Pkp4Q68FH0 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Pkp4Q68FH0 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
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Pkp4Q68FH0 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
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Pkp4Q68FH0 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Pkp4Q68FH0 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Pkp4Q68FH0 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
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Pkp4Q68FH0 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Pkp4Q68FH0 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Pkp4Q68FH0 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Pkp4Q68FH0 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Pkp4Q68FH0 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Pkp4Q68FH0 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Pkp4Q68FH0 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Pkp4Q68FH0 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Pkp4Q68FH0 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
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