Protein–RNA interactions for Protein: Q64287

Irf4, Interferon regulatory factor 4, mousemouse

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf4Q64287 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Irf4Q64287 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Irf4Q64287 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Irf4Q64287 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Irf4Q64287 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Irf4Q64287 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Irf4Q64287 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Irf4Q64287 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Irf4Q64287 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Irf4Q64287 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Irf4Q64287 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Irf4Q64287 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Irf4Q64287 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Irf4Q64287 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Irf4Q64287 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Irf4Q64287 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Irf4Q64287 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Irf4Q64287 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Irf4Q64287 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Irf4Q64287 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Irf4Q64287 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Irf4Q64287 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Irf4Q64287 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Irf4Q64287 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Irf4Q64287 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Irf4Q64287 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Irf4Q64287 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Irf4Q64287 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Irf4Q64287 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Irf4Q64287 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Irf4Q64287 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Irf4Q64287 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Irf4Q64287 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Irf4Q64287 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Irf4Q64287 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Irf4Q64287 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Irf4Q64287 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Irf4Q64287 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Irf4Q64287 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Irf4Q64287 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Irf4Q64287 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Irf4Q64287 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Irf4Q64287 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Irf4Q64287 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Irf4Q64287 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Irf4Q64287 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Irf4Q64287 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Irf4Q64287 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Irf4Q64287 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Irf4Q64287 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Irf4Q64287 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Irf4Q64287 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Irf4Q64287 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Irf4Q64287 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Irf4Q64287 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Irf4Q64287 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Irf4Q64287 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Irf4Q64287 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Irf4Q64287 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
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Irf4Q64287 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Irf4Q64287 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Irf4Q64287 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Irf4Q64287 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
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Irf4Q64287 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Irf4Q64287 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Irf4Q64287 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Irf4Q64287 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Irf4Q64287 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Irf4Q64287 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Irf4Q64287 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Irf4Q64287 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Irf4Q64287 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Irf4Q64287 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Irf4Q64287 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Irf4Q64287 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Irf4Q64287 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Irf4Q64287 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Irf4Q64287 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Irf4Q64287 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Irf4Q64287 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Irf4Q64287 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Irf4Q64287 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Irf4Q64287 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Irf4Q64287 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Irf4Q64287 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Irf4Q64287 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Irf4Q64287 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Irf4Q64287 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Irf4Q64287 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Irf4Q64287 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Irf4Q64287 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Irf4Q64287 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Irf4Q64287 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Irf4Q64287 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Irf4Q64287 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Irf4Q64287 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Irf4Q64287 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Irf4Q64287 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
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