Protein–RNA interactions for Protein: Q62241

Snrpc, U1 small nuclear ribonucleoprotein C, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnrpcQ62241 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
SnrpcQ62241 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
SnrpcQ62241 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
SnrpcQ62241 Gm9008-201ENSMUST00000097218 2353 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
SnrpcQ62241 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
SnrpcQ62241 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
SnrpcQ62241 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
SnrpcQ62241 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
SnrpcQ62241 Tsga10-202ENSMUST00000088072 3837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
SnrpcQ62241 Telo2-201ENSMUST00000024987 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
SnrpcQ62241 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
SnrpcQ62241 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
SnrpcQ62241 Ambra1-204ENSMUST00000111316 5063 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
SnrpcQ62241 Rai1-207ENSMUST00000171108 7125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
SnrpcQ62241 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
SnrpcQ62241 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
SnrpcQ62241 Tbcd-201ENSMUST00000103013 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
SnrpcQ62241 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
SnrpcQ62241 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
SnrpcQ62241 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
SnrpcQ62241 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
SnrpcQ62241 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
SnrpcQ62241 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
SnrpcQ62241 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
SnrpcQ62241 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
SnrpcQ62241 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
SnrpcQ62241 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
SnrpcQ62241 Derl2-202ENSMUST00000108523 884 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
SnrpcQ62241 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
SnrpcQ62241 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
SnrpcQ62241 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
SnrpcQ62241 AU022754-201ENSMUST00000180441 2976 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
SnrpcQ62241 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
SnrpcQ62241 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
SnrpcQ62241 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
SnrpcQ62241 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
SnrpcQ62241 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
SnrpcQ62241 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
SnrpcQ62241 Zfp941-201ENSMUST00000080651 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
SnrpcQ62241 Dock6-201ENSMUST00000034728 6467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
SnrpcQ62241 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
SnrpcQ62241 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
SnrpcQ62241 Ubap1-201ENSMUST00000072866 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
SnrpcQ62241 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
SnrpcQ62241 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
SnrpcQ62241 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
SnrpcQ62241 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
SnrpcQ62241 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
SnrpcQ62241 Per1-202ENSMUST00000101004 3507 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
SnrpcQ62241 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
SnrpcQ62241 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
SnrpcQ62241 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
SnrpcQ62241 Fads6-201ENSMUST00000056153 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
SnrpcQ62241 Gfm1-201ENSMUST00000077271 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
SnrpcQ62241 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
SnrpcQ62241 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
SnrpcQ62241 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
SnrpcQ62241 Vsx2-201ENSMUST00000021665 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
SnrpcQ62241 Tcf25-202ENSMUST00000108840 2582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
SnrpcQ62241 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
SnrpcQ62241 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
SnrpcQ62241 2810407A14Rik-201ENSMUST00000069809 1699 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
SnrpcQ62241 Ciz1-204ENSMUST00000113334 2871 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
SnrpcQ62241 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
SnrpcQ62241 Tcf4-234ENSMUST00000201410 1915 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
SnrpcQ62241 Tcf4-243ENSMUST00000202057 1941 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
SnrpcQ62241 Xpot-203ENSMUST00000218004 6005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
SnrpcQ62241 AI314180-202ENSMUST00000102889 7045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
SnrpcQ62241 BC017643-201ENSMUST00000038709 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
SnrpcQ62241 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
SnrpcQ62241 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
SnrpcQ62241 Zbtb40-201ENSMUST00000049583 7192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
SnrpcQ62241 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
SnrpcQ62241 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
SnrpcQ62241 Maats1-201ENSMUST00000023501 2750 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
SnrpcQ62241 AC124433.1-202ENSMUST00000224762 1535 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
SnrpcQ62241 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
SnrpcQ62241 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
SnrpcQ62241 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
SnrpcQ62241 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
SnrpcQ62241 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
SnrpcQ62241 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
SnrpcQ62241 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
SnrpcQ62241 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
SnrpcQ62241 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
SnrpcQ62241 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
SnrpcQ62241 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
SnrpcQ62241 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
SnrpcQ62241 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
SnrpcQ62241 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
SnrpcQ62241 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
SnrpcQ62241 Rin2-202ENSMUST00000110005 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
SnrpcQ62241 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
SnrpcQ62241 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
SnrpcQ62241 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
SnrpcQ62241 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
SnrpcQ62241 Galr1-201ENSMUST00000065224 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
SnrpcQ62241 Sgk1-213ENSMUST00000164659 2602 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
SnrpcQ62241 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
SnrpcQ62241 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms