Protein–RNA interactions for Protein: Q60972

Rbbp4, Histone-binding protein RBBP4, mousemouse

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp4Q60972 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rbbp4Q60972 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rbbp4Q60972 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rbbp4Q60972 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rbbp4Q60972 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rbbp4Q60972 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rbbp4Q60972 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Rbbp4Q60972 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rbbp4Q60972 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Rbbp4Q60972 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Rbbp4Q60972 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rbbp4Q60972 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Rbbp4Q60972 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Rbbp4Q60972 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Rbbp4Q60972 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Rbbp4Q60972 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rbbp4Q60972 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rbbp4Q60972 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rbbp4Q60972 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rbbp4Q60972 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rbbp4Q60972 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rbbp4Q60972 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rbbp4Q60972 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rbbp4Q60972 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rbbp4Q60972 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rbbp4Q60972 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Rbbp4Q60972 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rbbp4Q60972 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rbbp4Q60972 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rbbp4Q60972 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rbbp4Q60972 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rbbp4Q60972 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rbbp4Q60972 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Rbbp4Q60972 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rbbp4Q60972 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Rbbp4Q60972 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rbbp4Q60972 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rbbp4Q60972 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rbbp4Q60972 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rbbp4Q60972 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rbbp4Q60972 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rbbp4Q60972 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rbbp4Q60972 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rbbp4Q60972 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rbbp4Q60972 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rbbp4Q60972 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rbbp4Q60972 Tspoap1-201ENSMUST00000039627 7616 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rbbp4Q60972 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Rbbp4Q60972 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rbbp4Q60972 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rbbp4Q60972 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rbbp4Q60972 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rbbp4Q60972 Camta1-201ENSMUST00000049790 8423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rbbp4Q60972 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rbbp4Q60972 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rbbp4Q60972 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rbbp4Q60972 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rbbp4Q60972 Creb3l2-201ENSMUST00000041093 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rbbp4Q60972 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rbbp4Q60972 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rbbp4Q60972 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rbbp4Q60972 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rbbp4Q60972 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rbbp4Q60972 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rbbp4Q60972 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Rbbp4Q60972 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Rbbp4Q60972 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Rbbp4Q60972 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Rbbp4Q60972 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Rbbp4Q60972 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Rbbp4Q60972 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Rbbp4Q60972 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Rbbp4Q60972 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Rbbp4Q60972 Ttbk2-202ENSMUST00000057135 11066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Rbbp4Q60972 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Rbbp4Q60972 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Rbbp4Q60972 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Rbbp4Q60972 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Rbbp4Q60972 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Rbbp4Q60972 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Rbbp4Q60972 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Rbbp4Q60972 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Rbbp4Q60972 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Rbbp4Q60972 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Rbbp4Q60972 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Rbbp4Q60972 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Rbbp4Q60972 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Rbbp4Q60972 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Rbbp4Q60972 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Rbbp4Q60972 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Rbbp4Q60972 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Rbbp4Q60972 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Rbbp4Q60972 Pfas-201ENSMUST00000021282 6373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Rbbp4Q60972 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Rbbp4Q60972 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Rbbp4Q60972 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Rbbp4Q60972 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Rbbp4Q60972 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Rbbp4Q60972 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Rbbp4Q60972 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.5 ms