Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSW2

Psme4, Proteasome activator complex subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,843 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psme4Q5SSW2 Mir219a-1-201ENSMUST00000083621 110 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Psme4Q5SSW2 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Psme4Q5SSW2 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Psme4Q5SSW2 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Psme4Q5SSW2 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Psme4Q5SSW2 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Psme4Q5SSW2 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Psme4Q5SSW2 Gm11924-201ENSMUST00000152306 1750 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Psme4Q5SSW2 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Psme4Q5SSW2 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Psme4Q5SSW2 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Psme4Q5SSW2 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Psme4Q5SSW2 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Psme4Q5SSW2 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Psme4Q5SSW2 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Psme4Q5SSW2 Pcgf1-207ENSMUST00000177177 854 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Psme4Q5SSW2 3110045C21Rik-201ENSMUST00000180638 1135 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Psme4Q5SSW2 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
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Psme4Q5SSW2 Mlf1-201ENSMUST00000061322 1113 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Psme4Q5SSW2 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Psme4Q5SSW2 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Psme4Q5SSW2 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Psme4Q5SSW2 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Psme4Q5SSW2 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Psme4Q5SSW2 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Psme4Q5SSW2 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Psme4Q5SSW2 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Psme4Q5SSW2 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Psme4Q5SSW2 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Psme4Q5SSW2 Ttc4-202ENSMUST00000106772 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Psme4Q5SSW2 Gm12589-201ENSMUST00000153767 638 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Psme4Q5SSW2 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Psme4Q5SSW2 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Psme4Q5SSW2 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Psme4Q5SSW2 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Psme4Q5SSW2 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Psme4Q5SSW2 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Psme4Q5SSW2 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Psme4Q5SSW2 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Psme4Q5SSW2 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Psme4Q5SSW2 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Psme4Q5SSW2 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Psme4Q5SSW2 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Psme4Q5SSW2 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Psme4Q5SSW2 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Psme4Q5SSW2 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Psme4Q5SSW2 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Psme4Q5SSW2 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Psme4Q5SSW2 Tm2d3-203ENSMUST00000107495 1003 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Psme4Q5SSW2 Pdxk-ps-202ENSMUST00000160550 876 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Psme4Q5SSW2 Sap25-201ENSMUST00000166099 1101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Psme4Q5SSW2 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Psme4Q5SSW2 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Psme4Q5SSW2 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Psme4Q5SSW2 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Psme4Q5SSW2 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Psme4Q5SSW2 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Psme4Q5SSW2 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Psme4Q5SSW2 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Psme4Q5SSW2 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Psme4Q5SSW2 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Psme4Q5SSW2 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Psme4Q5SSW2 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
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