Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSH7

Zzef1, Zinc finger ZZ-type and EF-hand domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 2,924 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zzef1Q5SSH7 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Zzef1Q5SSH7 Gm13668-201ENSMUST00000119237 1001 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Zzef1Q5SSH7 Gm15523-201ENSMUST00000160463 439 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Zzef1Q5SSH7 Gm18201-201ENSMUST00000174735 875 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Zzef1Q5SSH7 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Zzef1Q5SSH7 Stt3a-209ENSMUST00000217599 285 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Zzef1Q5SSH7 Gm270-201ENSMUST00000223010 976 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Zzef1Q5SSH7 CT025553.1-201ENSMUST00000226292 299 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Zzef1Q5SSH7 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Zzef1Q5SSH7 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Zzef1Q5SSH7 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Zzef1Q5SSH7 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Zzef1Q5SSH7 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Zzef1Q5SSH7 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Zzef1Q5SSH7 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Zzef1Q5SSH7 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Zzef1Q5SSH7 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Zzef1Q5SSH7 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Zzef1Q5SSH7 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Zzef1Q5SSH7 Gm12501-201ENSMUST00000119163 529 ntBASIC11.27□□□□□ -0.6
Zzef1Q5SSH7 BB557941-201ENSMUST00000126549 1097 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Zzef1Q5SSH7 4930483J18Rik-202ENSMUST00000138715 1093 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Zzef1Q5SSH7 Aknaos-201ENSMUST00000144095 1104 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Zzef1Q5SSH7 AA387200-201ENSMUST00000147463 1177 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Zzef1Q5SSH7 Plgrkt-209ENSMUST00000152936 604 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Zzef1Q5SSH7 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Zzef1Q5SSH7 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Zzef1Q5SSH7 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Zzef1Q5SSH7 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Zzef1Q5SSH7 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Zzef1Q5SSH7 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Zzef1Q5SSH7 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Zzef1Q5SSH7 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Zzef1Q5SSH7 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Zzef1Q5SSH7 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Zzef1Q5SSH7 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Zzef1Q5SSH7 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Zzef1Q5SSH7 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Zzef1Q5SSH7 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Zzef1Q5SSH7 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Zzef1Q5SSH7 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Zzef1Q5SSH7 Tcea3-201ENSMUST00000102533 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Zzef1Q5SSH7 Vbp1-202ENSMUST00000114070 632 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Zzef1Q5SSH7 Gm13809-201ENSMUST00000117921 597 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Zzef1Q5SSH7 Gm28778-201ENSMUST00000190734 785 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Zzef1Q5SSH7 Gm43050-202ENSMUST00000201152 651 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Zzef1Q5SSH7 Orc4-202ENSMUST00000090976 1153 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Zzef1Q5SSH7 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Zzef1Q5SSH7 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Zzef1Q5SSH7 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Zzef1Q5SSH7 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Zzef1Q5SSH7 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Zzef1Q5SSH7 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Zzef1Q5SSH7 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Zzef1Q5SSH7 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Zzef1Q5SSH7 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Zzef1Q5SSH7 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Zzef1Q5SSH7 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Zzef1Q5SSH7 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Zzef1Q5SSH7 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Zzef1Q5SSH7 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Zzef1Q5SSH7 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Zzef1Q5SSH7 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Zzef1Q5SSH7 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Zzef1Q5SSH7 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Zzef1Q5SSH7 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Zzef1Q5SSH7 B230206L02Rik-202ENSMUST00000132584 695 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Zzef1Q5SSH7 Gm4726-201ENSMUST00000135604 736 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Zzef1Q5SSH7 Gm6019-201ENSMUST00000148369 736 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Zzef1Q5SSH7 Magohb-205ENSMUST00000173837 897 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Zzef1Q5SSH7 Gm22877-201ENSMUST00000175451 105 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Zzef1Q5SSH7 S100a3-205ENSMUST00000200508 587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Zzef1Q5SSH7 Ighv1-86-201ENSMUST00000200562 353 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Zzef1Q5SSH7 Gm44953-201ENSMUST00000208745 1286 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Zzef1Q5SSH7 AC153505.1-201ENSMUST00000218819 1071 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Zzef1Q5SSH7 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Zzef1Q5SSH7 Hspb11-201ENSMUST00000046558 608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Zzef1Q5SSH7 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Zzef1Q5SSH7 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Zzef1Q5SSH7 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Zzef1Q5SSH7 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Zzef1Q5SSH7 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Zzef1Q5SSH7 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Zzef1Q5SSH7 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Zzef1Q5SSH7 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Zzef1Q5SSH7 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Zzef1Q5SSH7 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Zzef1Q5SSH7 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Zzef1Q5SSH7 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Zzef1Q5SSH7 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Zzef1Q5SSH7 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Zzef1Q5SSH7 Cenpx-203ENSMUST00000106154 873 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Zzef1Q5SSH7 Zscan10-203ENSMUST00000117606 891 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Zzef1Q5SSH7 Gm15595-201ENSMUST00000120840 961 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Zzef1Q5SSH7 Fxyd5-209ENSMUST00000162087 762 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Zzef1Q5SSH7 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Zzef1Q5SSH7 Gm6855-201ENSMUST00000206307 790 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Zzef1Q5SSH7 Prss55-201ENSMUST00000089338 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Zzef1Q5SSH7 Gm5544-201ENSMUST00000098828 891 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Zzef1Q5SSH7 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms