Protein–RNA interactions for Protein: Q5SPL2

Phf12, PHD finger protein 12, mousemouse

Predictions only

Length 1,003 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf12Q5SPL2 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Phf12Q5SPL2 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Phf12Q5SPL2 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Phf12Q5SPL2 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Phf12Q5SPL2 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Phf12Q5SPL2 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Phf12Q5SPL2 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Phf12Q5SPL2 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Phf12Q5SPL2 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Phf12Q5SPL2 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Phf12Q5SPL2 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Phf12Q5SPL2 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Phf12Q5SPL2 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Phf12Q5SPL2 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Phf12Q5SPL2 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Phf12Q5SPL2 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Phf12Q5SPL2 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Phf12Q5SPL2 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Phf12Q5SPL2 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Phf12Q5SPL2 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Phf12Q5SPL2 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Phf12Q5SPL2 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Phf12Q5SPL2 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Phf12Q5SPL2 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Phf12Q5SPL2 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Phf12Q5SPL2 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Phf12Q5SPL2 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Phf12Q5SPL2 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Phf12Q5SPL2 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Phf12Q5SPL2 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Phf12Q5SPL2 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Phf12Q5SPL2 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Phf12Q5SPL2 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Phf12Q5SPL2 Ighv10-4-201ENSMUST00000193702 299 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Phf12Q5SPL2 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Phf12Q5SPL2 Gm2861-201ENSMUST00000199885 666 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Phf12Q5SPL2 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Phf12Q5SPL2 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Phf12Q5SPL2 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Phf12Q5SPL2 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Phf12Q5SPL2 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Phf12Q5SPL2 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Phf12Q5SPL2 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Phf12Q5SPL2 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Phf12Q5SPL2 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Phf12Q5SPL2 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Phf12Q5SPL2 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Phf12Q5SPL2 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Phf12Q5SPL2 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Phf12Q5SPL2 AI464131-201ENSMUST00000054920 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Phf12Q5SPL2 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Phf12Q5SPL2 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Phf12Q5SPL2 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Phf12Q5SPL2 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Phf12Q5SPL2 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Phf12Q5SPL2 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Phf12Q5SPL2 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Phf12Q5SPL2 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Phf12Q5SPL2 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Phf12Q5SPL2 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Phf12Q5SPL2 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Phf12Q5SPL2 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Phf12Q5SPL2 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Phf12Q5SPL2 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Phf12Q5SPL2 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Phf12Q5SPL2 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Phf12Q5SPL2 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Phf12Q5SPL2 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Phf12Q5SPL2 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Phf12Q5SPL2 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Phf12Q5SPL2 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Phf12Q5SPL2 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Phf12Q5SPL2 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Phf12Q5SPL2 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Phf12Q5SPL2 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Phf12Q5SPL2 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Phf12Q5SPL2 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Phf12Q5SPL2 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Phf12Q5SPL2 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Phf12Q5SPL2 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Phf12Q5SPL2 Adam3-210ENSMUST00000171611 1202 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Phf12Q5SPL2 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Phf12Q5SPL2 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Phf12Q5SPL2 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Phf12Q5SPL2 Gm35611-201ENSMUST00000205323 799 ntTSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Phf12Q5SPL2 Gm44548-201ENSMUST00000208929 192 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Phf12Q5SPL2 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Phf12Q5SPL2 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Phf12Q5SPL2 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Phf12Q5SPL2 Ccdc54-201ENSMUST00000062439 1296 ntAPPRIS P1 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Phf12Q5SPL2 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Phf12Q5SPL2 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Phf12Q5SPL2 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Phf12Q5SPL2 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Phf12Q5SPL2 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Phf12Q5SPL2 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Phf12Q5SPL2 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Phf12Q5SPL2 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Phf12Q5SPL2 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Phf12Q5SPL2 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms