Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCF2

Trappc1, Trafficking protein particle complex subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc1Q5NCF2 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Trappc1Q5NCF2 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Trappc1Q5NCF2 Gm43984-201ENSMUST00000204572 2864 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Trappc1Q5NCF2 Arhgef2-206ENSMUST00000175779 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Trappc1Q5NCF2 Fut4-201ENSMUST00000061498 4074 ntAPPRIS P1 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Trappc1Q5NCF2 Tctn1-201ENSMUST00000111738 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Trappc1Q5NCF2 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Trappc1Q5NCF2 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Trappc1Q5NCF2 Ahsa2-202ENSMUST00000109539 3583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Trappc1Q5NCF2 Gng7-203ENSMUST00000117805 3382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Trappc1Q5NCF2 Plg-201ENSMUST00000014578 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Trappc1Q5NCF2 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Trappc1Q5NCF2 Ppp2r1b-202ENSMUST00000114437 3430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Trappc1Q5NCF2 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Trappc1Q5NCF2 Dnajc5-203ENSMUST00000108797 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Trappc1Q5NCF2 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Trappc1Q5NCF2 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Trappc1Q5NCF2 Sh3pxd2a-201ENSMUST00000081619 10464 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Trappc1Q5NCF2 Pafah2-201ENSMUST00000105869 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Trappc1Q5NCF2 Spop-201ENSMUST00000107722 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Trappc1Q5NCF2 Mapk8ip3-204ENSMUST00000117509 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Trappc1Q5NCF2 Nol6-201ENSMUST00000030138 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Trappc1Q5NCF2 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Trappc1Q5NCF2 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Trappc1Q5NCF2 Il6st-201ENSMUST00000070731 5207 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Trappc1Q5NCF2 AC122840.1-201ENSMUST00000220915 3334 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Trappc1Q5NCF2 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Trappc1Q5NCF2 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Trappc1Q5NCF2 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Trappc1Q5NCF2 Ppp1r18-202ENSMUST00000122899 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Trappc1Q5NCF2 Pcdhga6-201ENSMUST00000195823 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Trappc1Q5NCF2 Emc1-201ENSMUST00000042096 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Trappc1Q5NCF2 Sfxn3-201ENSMUST00000062213 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Trappc1Q5NCF2 Srrm2-201ENSMUST00000088621 8564 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Trappc1Q5NCF2 Zfp518b-203ENSMUST00000179555 6816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Trappc1Q5NCF2 Trim45-201ENSMUST00000037409 4612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Trappc1Q5NCF2 Chtop-201ENSMUST00000001043 3257 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Trappc1Q5NCF2 Myocd-203ENSMUST00000108695 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Trappc1Q5NCF2 Lbh-201ENSMUST00000024857 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Trappc1Q5NCF2 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Trappc1Q5NCF2 Gipr-201ENSMUST00000094790 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Trappc1Q5NCF2 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Trappc1Q5NCF2 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Trappc1Q5NCF2 Slc17a5-202ENSMUST00000117645 3114 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Trappc1Q5NCF2 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Trappc1Q5NCF2 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Trappc1Q5NCF2 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Trappc1Q5NCF2 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Trappc1Q5NCF2 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Trappc1Q5NCF2 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Trappc1Q5NCF2 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Trappc1Q5NCF2 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Trappc1Q5NCF2 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Trappc1Q5NCF2 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Trappc1Q5NCF2 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Trappc1Q5NCF2 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Trappc1Q5NCF2 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Trappc1Q5NCF2 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Trappc1Q5NCF2 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Trappc1Q5NCF2 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Trappc1Q5NCF2 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Trappc1Q5NCF2 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Trappc1Q5NCF2 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Trappc1Q5NCF2 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Trappc1Q5NCF2 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Trappc1Q5NCF2 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Trappc1Q5NCF2 Pcgf2-207ENSMUST00000179765 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Trappc1Q5NCF2 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Trappc1Q5NCF2 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Trappc1Q5NCF2 Gm15541-201ENSMUST00000147449 2713 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Trappc1Q5NCF2 Plekhn1-202ENSMUST00000105571 2004 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Trappc1Q5NCF2 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Trappc1Q5NCF2 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Trappc1Q5NCF2 Scn10a-202ENSMUST00000213392 6692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Trappc1Q5NCF2 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Trappc1Q5NCF2 Gm26778-201ENSMUST00000181443 3805 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Trappc1Q5NCF2 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Trappc1Q5NCF2 Gm4316-201ENSMUST00000212411 2617 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Trappc1Q5NCF2 Sppl2b-211ENSMUST00000220091 3629 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Trappc1Q5NCF2 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Trappc1Q5NCF2 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Trappc1Q5NCF2 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Trappc1Q5NCF2 Zfp46-201ENSMUST00000069195 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Trappc1Q5NCF2 Spred2-201ENSMUST00000093298 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Trappc1Q5NCF2 Epb42-201ENSMUST00000023987 2695 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Trappc1Q5NCF2 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Trappc1Q5NCF2 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Trappc1Q5NCF2 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Trappc1Q5NCF2 Lamb1-205ENSMUST00000169088 5557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Trappc1Q5NCF2 Tshz3-201ENSMUST00000021641 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Trappc1Q5NCF2 Zfp710-202ENSMUST00000164056 5871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Trappc1Q5NCF2 B930036N10Rik-202ENSMUST00000181170 3544 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Trappc1Q5NCF2 Dcaf8-202ENSMUST00000191689 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Trappc1Q5NCF2 Abat-201ENSMUST00000065987 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Trappc1Q5NCF2 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Trappc1Q5NCF2 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Trappc1Q5NCF2 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Trappc1Q5NCF2 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Trappc1Q5NCF2 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Trappc1Q5NCF2 Rragd-202ENSMUST00000084747 4295 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms