Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCC9

Trim58, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM58, mousemouse

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Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim58Q5NCC9 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
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Trim58Q5NCC9 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
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Trim58Q5NCC9 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trim58Q5NCC9 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trim58Q5NCC9 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
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Trim58Q5NCC9 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
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Trim58Q5NCC9 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
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Trim58Q5NCC9 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trim58Q5NCC9 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trim58Q5NCC9 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trim58Q5NCC9 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
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Trim58Q5NCC9 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trim58Q5NCC9 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trim58Q5NCC9 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trim58Q5NCC9 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.8 ms