Protein–RNA interactions for Protein: Q5F204

Mdh1b, Putative malate dehydrogenase 1B, mousemouse

Predictions only

Length 500 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mdh1bQ5F204 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mdh1bQ5F204 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mdh1bQ5F204 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mdh1bQ5F204 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mdh1bQ5F204 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mdh1bQ5F204 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mdh1bQ5F204 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Mdh1bQ5F204 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mdh1bQ5F204 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mdh1bQ5F204 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Mdh1bQ5F204 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mdh1bQ5F204 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Mdh1bQ5F204 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mdh1bQ5F204 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mdh1bQ5F204 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mdh1bQ5F204 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mdh1bQ5F204 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mdh1bQ5F204 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mdh1bQ5F204 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mdh1bQ5F204 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mdh1bQ5F204 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mdh1bQ5F204 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mdh1bQ5F204 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mdh1bQ5F204 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Mdh1bQ5F204 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mdh1bQ5F204 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mdh1bQ5F204 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mdh1bQ5F204 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mdh1bQ5F204 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mdh1bQ5F204 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mdh1bQ5F204 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mdh1bQ5F204 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mdh1bQ5F204 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mdh1bQ5F204 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mdh1bQ5F204 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mdh1bQ5F204 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Mdh1bQ5F204 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Mdh1bQ5F204 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Mdh1bQ5F204 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mdh1bQ5F204 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mdh1bQ5F204 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mdh1bQ5F204 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mdh1bQ5F204 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mdh1bQ5F204 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mdh1bQ5F204 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Mdh1bQ5F204 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Mdh1bQ5F204 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mdh1bQ5F204 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mdh1bQ5F204 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mdh1bQ5F204 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Mdh1bQ5F204 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Mdh1bQ5F204 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mdh1bQ5F204 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mdh1bQ5F204 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mdh1bQ5F204 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mdh1bQ5F204 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mdh1bQ5F204 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mdh1bQ5F204 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mdh1bQ5F204 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mdh1bQ5F204 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mdh1bQ5F204 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mdh1bQ5F204 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.2 ms