Protein–RNA interactions for Protein: Q4FK66

Prpf38a, Pre-mRNA-splicing factor 38A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf38aQ4FK66 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prpf38aQ4FK66 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Prpf38aQ4FK66 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prpf38aQ4FK66 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Prpf38aQ4FK66 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prpf38aQ4FK66 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prpf38aQ4FK66 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prpf38aQ4FK66 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prpf38aQ4FK66 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prpf38aQ4FK66 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prpf38aQ4FK66 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Prpf38aQ4FK66 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prpf38aQ4FK66 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prpf38aQ4FK66 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Prpf38aQ4FK66 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prpf38aQ4FK66 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prpf38aQ4FK66 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prpf38aQ4FK66 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prpf38aQ4FK66 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prpf38aQ4FK66 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prpf38aQ4FK66 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prpf38aQ4FK66 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prpf38aQ4FK66 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prpf38aQ4FK66 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prpf38aQ4FK66 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prpf38aQ4FK66 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prpf38aQ4FK66 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prpf38aQ4FK66 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prpf38aQ4FK66 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prpf38aQ4FK66 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prpf38aQ4FK66 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prpf38aQ4FK66 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prpf38aQ4FK66 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prpf38aQ4FK66 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Prpf38aQ4FK66 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prpf38aQ4FK66 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prpf38aQ4FK66 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prpf38aQ4FK66 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prpf38aQ4FK66 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prpf38aQ4FK66 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prpf38aQ4FK66 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prpf38aQ4FK66 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prpf38aQ4FK66 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Prpf38aQ4FK66 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prpf38aQ4FK66 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Prpf38aQ4FK66 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prpf38aQ4FK66 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prpf38aQ4FK66 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prpf38aQ4FK66 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prpf38aQ4FK66 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prpf38aQ4FK66 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prpf38aQ4FK66 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prpf38aQ4FK66 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prpf38aQ4FK66 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prpf38aQ4FK66 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prpf38aQ4FK66 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prpf38aQ4FK66 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prpf38aQ4FK66 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Prpf38aQ4FK66 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prpf38aQ4FK66 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Prpf38aQ4FK66 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Prpf38aQ4FK66 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prpf38aQ4FK66 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Prpf38aQ4FK66 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prpf38aQ4FK66 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prpf38aQ4FK66 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Prpf38aQ4FK66 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prpf38aQ4FK66 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prpf38aQ4FK66 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prpf38aQ4FK66 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prpf38aQ4FK66 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prpf38aQ4FK66 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prpf38aQ4FK66 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prpf38aQ4FK66 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prpf38aQ4FK66 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prpf38aQ4FK66 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prpf38aQ4FK66 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prpf38aQ4FK66 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prpf38aQ4FK66 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prpf38aQ4FK66 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Prpf38aQ4FK66 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prpf38aQ4FK66 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prpf38aQ4FK66 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prpf38aQ4FK66 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prpf38aQ4FK66 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prpf38aQ4FK66 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prpf38aQ4FK66 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prpf38aQ4FK66 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prpf38aQ4FK66 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prpf38aQ4FK66 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prpf38aQ4FK66 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Prpf38aQ4FK66 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prpf38aQ4FK66 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prpf38aQ4FK66 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prpf38aQ4FK66 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prpf38aQ4FK66 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prpf38aQ4FK66 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Prpf38aQ4FK66 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Prpf38aQ4FK66 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prpf38aQ4FK66 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.9 ms