Protein–RNA interactions for Protein: Q4ACU6

Shank3, SH3 and multiple ankyrin repeat domains protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,730 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shank3Q4ACU6 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Shank3Q4ACU6 Cyp2a12-201ENSMUST00000075552 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Shank3Q4ACU6 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Shank3Q4ACU6 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Shank3Q4ACU6 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Shank3Q4ACU6 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Shank3Q4ACU6 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Shank3Q4ACU6 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Shank3Q4ACU6 Dnajb12-203ENSMUST00000142819 1495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Shank3Q4ACU6 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Shank3Q4ACU6 Arl6ip5-201ENSMUST00000044681 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Shank3Q4ACU6 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Shank3Q4ACU6 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Shank3Q4ACU6 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Shank3Q4ACU6 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Shank3Q4ACU6 Gm11211-201ENSMUST00000143618 359 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Shank3Q4ACU6 Atp10d-206ENSMUST00000169617 761 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Shank3Q4ACU6 Gm20535-201ENSMUST00000173157 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Shank3Q4ACU6 9030616G12Rik-201ENSMUST00000181142 644 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Shank3Q4ACU6 Gm19287-201ENSMUST00000203190 358 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Shank3Q4ACU6 Gm17827-201ENSMUST00000211825 742 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Shank3Q4ACU6 Tepp-207ENSMUST00000212056 613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Shank3Q4ACU6 Gm11938-201ENSMUST00000072306 663 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Shank3Q4ACU6 Sftpd-201ENSMUST00000077136 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Shank3Q4ACU6 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Shank3Q4ACU6 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Shank3Q4ACU6 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Shank3Q4ACU6 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Shank3Q4ACU6 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Shank3Q4ACU6 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Shank3Q4ACU6 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Shank3Q4ACU6 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Shank3Q4ACU6 Ppil6-201ENSMUST00000105507 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Shank3Q4ACU6 Gm12196-201ENSMUST00000120954 262 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Shank3Q4ACU6 9430091E24Rik-201ENSMUST00000127301 1067 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Shank3Q4ACU6 Gm53-203ENSMUST00000143887 757 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Shank3Q4ACU6 Rps28-203ENSMUST00000173019 437 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Shank3Q4ACU6 Gm4607-201ENSMUST00000206649 577 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Shank3Q4ACU6 Gm4797-201ENSMUST00000219075 1283 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Shank3Q4ACU6 AC099645.1-201ENSMUST00000226476 1105 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Shank3Q4ACU6 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Shank3Q4ACU6 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Shank3Q4ACU6 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Shank3Q4ACU6 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Shank3Q4ACU6 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Shank3Q4ACU6 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Shank3Q4ACU6 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Shank3Q4ACU6 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Shank3Q4ACU6 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Shank3Q4ACU6 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Shank3Q4ACU6 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Shank3Q4ACU6 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Shank3Q4ACU6 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Shank3Q4ACU6 Sirt2-209ENSMUST00000170068 1585 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Shank3Q4ACU6 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Shank3Q4ACU6 Gm14644-201ENSMUST00000116671 647 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Shank3Q4ACU6 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Shank3Q4ACU6 Ccdc127-205ENSMUST00000162672 677 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Shank3Q4ACU6 Plac9a-202ENSMUST00000183431 536 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Shank3Q4ACU6 Plac9b-204ENSMUST00000184675 536 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Shank3Q4ACU6 Gm9230-201ENSMUST00000188228 532 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Shank3Q4ACU6 1700081H04Rik-201ENSMUST00000190550 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Shank3Q4ACU6 AC107638.1-201ENSMUST00000213690 1061 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Shank3Q4ACU6 Arhgef33-207ENSMUST00000224966 490 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Shank3Q4ACU6 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Shank3Q4ACU6 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Shank3Q4ACU6 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Shank3Q4ACU6 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Shank3Q4ACU6 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Shank3Q4ACU6 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Shank3Q4ACU6 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Shank3Q4ACU6 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Shank3Q4ACU6 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Shank3Q4ACU6 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Shank3Q4ACU6 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Shank3Q4ACU6 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Shank3Q4ACU6 Gsdmcl-ps-203ENSMUST00000188367 1375 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Shank3Q4ACU6 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Shank3Q4ACU6 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Shank3Q4ACU6 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Shank3Q4ACU6 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Shank3Q4ACU6 Mup-ps26-201ENSMUST00000121751 202 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Shank3Q4ACU6 Rps2-ps4-201ENSMUST00000121977 633 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Shank3Q4ACU6 Ankrd29-202ENSMUST00000122408 850 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Shank3Q4ACU6 Spx-202ENSMUST00000126521 357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Shank3Q4ACU6 Gm10731-201ENSMUST00000181171 448 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Shank3Q4ACU6 Gm5732-201ENSMUST00000182596 1007 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Shank3Q4ACU6 AC124457.1-201ENSMUST00000198845 120 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Shank3Q4ACU6 Gm45285-201ENSMUST00000210418 749 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Shank3Q4ACU6 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Shank3Q4ACU6 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Shank3Q4ACU6 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Shank3Q4ACU6 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Shank3Q4ACU6 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Shank3Q4ACU6 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Shank3Q4ACU6 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Shank3Q4ACU6 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Shank3Q4ACU6 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Shank3Q4ACU6 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Shank3Q4ACU6 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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