Protein–RNA interactions for Protein: Q3US17

Znf48, Zinc finger protein 48, mousemouse

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf48Q3US17 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Znf48Q3US17 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Znf48Q3US17 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Znf48Q3US17 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Znf48Q3US17 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Znf48Q3US17 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Znf48Q3US17 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Znf48Q3US17 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Znf48Q3US17 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Znf48Q3US17 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Znf48Q3US17 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Znf48Q3US17 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Znf48Q3US17 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Znf48Q3US17 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Znf48Q3US17 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Znf48Q3US17 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Znf48Q3US17 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Znf48Q3US17 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Znf48Q3US17 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Znf48Q3US17 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Znf48Q3US17 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Znf48Q3US17 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Znf48Q3US17 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Znf48Q3US17 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Znf48Q3US17 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Znf48Q3US17 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Znf48Q3US17 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Znf48Q3US17 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Znf48Q3US17 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Znf48Q3US17 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Znf48Q3US17 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Znf48Q3US17 Gm14659-201ENSMUST00000117667 843 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Znf48Q3US17 Tmsb15l-201ENSMUST00000127404 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Znf48Q3US17 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Znf48Q3US17 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Znf48Q3US17 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Znf48Q3US17 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Znf48Q3US17 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Znf48Q3US17 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Znf48Q3US17 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Znf48Q3US17 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Znf48Q3US17 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Znf48Q3US17 Gm38217-201ENSMUST00000194358 910 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Znf48Q3US17 Gm37017-201ENSMUST00000195266 747 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Znf48Q3US17 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Znf48Q3US17 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Znf48Q3US17 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Znf48Q3US17 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Znf48Q3US17 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Znf48Q3US17 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Znf48Q3US17 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Znf48Q3US17 AC116589.3-201ENSMUST00000223034 1165 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Znf48Q3US17 Prl7a1-203ENSMUST00000224852 1283 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Znf48Q3US17 AC102542.1-201ENSMUST00000225204 1138 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Znf48Q3US17 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Znf48Q3US17 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Znf48Q3US17 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Znf48Q3US17 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Znf48Q3US17 Prl7a1-201ENSMUST00000006659 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Znf48Q3US17 1700011I03Rik-201ENSMUST00000079738 1013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Znf48Q3US17 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Znf48Q3US17 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Znf48Q3US17 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Znf48Q3US17 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Znf48Q3US17 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Znf48Q3US17 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Znf48Q3US17 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Znf48Q3US17 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Znf48Q3US17 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Znf48Q3US17 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Znf48Q3US17 Mast4-207ENSMUST00000167058 10636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Znf48Q3US17 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Znf48Q3US17 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Znf48Q3US17 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Znf48Q3US17 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Znf48Q3US17 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Znf48Q3US17 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Znf48Q3US17 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Znf48Q3US17 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Znf48Q3US17 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Znf48Q3US17 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Znf48Q3US17 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Znf48Q3US17 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Znf48Q3US17 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Znf48Q3US17 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Znf48Q3US17 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Znf48Q3US17 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Znf48Q3US17 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Znf48Q3US17 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Znf48Q3US17 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Znf48Q3US17 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Znf48Q3US17 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Znf48Q3US17 Gm3676-201ENSMUST00000111869 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Znf48Q3US17 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Znf48Q3US17 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Znf48Q3US17 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Znf48Q3US17 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Znf48Q3US17 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Znf48Q3US17 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Znf48Q3US17 Gm17066-202ENSMUST00000165350 1113 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.4 ms