Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJD6

Usp19, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 19, mousemouse

Predictions only

Length 1,360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp19Q3UJD6 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Usp19Q3UJD6 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Usp19Q3UJD6 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Usp19Q3UJD6 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Usp19Q3UJD6 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Usp19Q3UJD6 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Usp19Q3UJD6 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Usp19Q3UJD6 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Usp19Q3UJD6 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Usp19Q3UJD6 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Usp19Q3UJD6 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Usp19Q3UJD6 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Usp19Q3UJD6 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Usp19Q3UJD6 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Usp19Q3UJD6 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Usp19Q3UJD6 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Usp19Q3UJD6 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Usp19Q3UJD6 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Usp19Q3UJD6 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Usp19Q3UJD6 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Usp19Q3UJD6 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Usp19Q3UJD6 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Usp19Q3UJD6 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Usp19Q3UJD6 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Usp19Q3UJD6 Gm11791-201ENSMUST00000139327 336 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Usp19Q3UJD6 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Usp19Q3UJD6 Gm3961-201ENSMUST00000204425 994 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Usp19Q3UJD6 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Usp19Q3UJD6 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Usp19Q3UJD6 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Usp19Q3UJD6 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Usp19Q3UJD6 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Usp19Q3UJD6 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Usp19Q3UJD6 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Usp19Q3UJD6 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Usp19Q3UJD6 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Usp19Q3UJD6 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Usp19Q3UJD6 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Usp19Q3UJD6 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Usp19Q3UJD6 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Usp19Q3UJD6 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Usp19Q3UJD6 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Usp19Q3UJD6 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Usp19Q3UJD6 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Usp19Q3UJD6 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Usp19Q3UJD6 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Usp19Q3UJD6 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Usp19Q3UJD6 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Usp19Q3UJD6 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Usp19Q3UJD6 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Usp19Q3UJD6 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Usp19Q3UJD6 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Usp19Q3UJD6 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Usp19Q3UJD6 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Usp19Q3UJD6 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Usp19Q3UJD6 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Usp19Q3UJD6 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Usp19Q3UJD6 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Usp19Q3UJD6 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Usp19Q3UJD6 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Usp19Q3UJD6 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Usp19Q3UJD6 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Usp19Q3UJD6 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Usp19Q3UJD6 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Usp19Q3UJD6 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Usp19Q3UJD6 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Usp19Q3UJD6 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Usp19Q3UJD6 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Usp19Q3UJD6 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Usp19Q3UJD6 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Usp19Q3UJD6 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Usp19Q3UJD6 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Usp19Q3UJD6 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Usp19Q3UJD6 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Usp19Q3UJD6 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Usp19Q3UJD6 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Usp19Q3UJD6 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Usp19Q3UJD6 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Usp19Q3UJD6 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Usp19Q3UJD6 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Usp19Q3UJD6 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Usp19Q3UJD6 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Usp19Q3UJD6 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Usp19Q3UJD6 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Usp19Q3UJD6 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Usp19Q3UJD6 Gm29199-201ENSMUST00000187766 775 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Usp19Q3UJD6 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Usp19Q3UJD6 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Usp19Q3UJD6 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Usp19Q3UJD6 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Usp19Q3UJD6 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Usp19Q3UJD6 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Usp19Q3UJD6 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Usp19Q3UJD6 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Usp19Q3UJD6 Txn2-201ENSMUST00000005487 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Usp19Q3UJD6 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Usp19Q3UJD6 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Usp19Q3UJD6 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Usp19Q3UJD6 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Usp19Q3UJD6 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.6 ms