Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJB0

Sf3b2, Splicing factor 3b, subunit 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 878 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b2Q3UJB0 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sf3b2Q3UJB0 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sf3b2Q3UJB0 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sf3b2Q3UJB0 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sf3b2Q3UJB0 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sf3b2Q3UJB0 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sf3b2Q3UJB0 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sf3b2Q3UJB0 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sf3b2Q3UJB0 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sf3b2Q3UJB0 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sf3b2Q3UJB0 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sf3b2Q3UJB0 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sf3b2Q3UJB0 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sf3b2Q3UJB0 Cd300ld2-202ENSMUST00000106578 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sf3b2Q3UJB0 Ssc4d-202ENSMUST00000111150 459 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sf3b2Q3UJB0 Fam129a-203ENSMUST00000111875 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sf3b2Q3UJB0 9430091E24Rik-201ENSMUST00000127301 1067 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sf3b2Q3UJB0 Gm16308-201ENSMUST00000162171 940 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sf3b2Q3UJB0 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sf3b2Q3UJB0 Gm29155-201ENSMUST00000185910 269 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Sf3b2Q3UJB0 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sf3b2Q3UJB0 Gm33222-201ENSMUST00000193725 654 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sf3b2Q3UJB0 Vdac1-201ENSMUST00000020673 891 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sf3b2Q3UJB0 Gm7207-201ENSMUST00000211575 1067 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Sf3b2Q3UJB0 AC101677.2-201ENSMUST00000218733 741 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sf3b2Q3UJB0 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sf3b2Q3UJB0 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sf3b2Q3UJB0 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sf3b2Q3UJB0 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sf3b2Q3UJB0 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sf3b2Q3UJB0 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sf3b2Q3UJB0 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sf3b2Q3UJB0 Nrf1-219ENSMUST00000167972 1541 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sf3b2Q3UJB0 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Sf3b2Q3UJB0 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sf3b2Q3UJB0 Nr1i3-202ENSMUST00000075469 1305 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sf3b2Q3UJB0 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sf3b2Q3UJB0 Gm11924-201ENSMUST00000152306 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sf3b2Q3UJB0 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sf3b2Q3UJB0 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sf3b2Q3UJB0 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sf3b2Q3UJB0 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sf3b2Q3UJB0 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sf3b2Q3UJB0 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sf3b2Q3UJB0 Ctrc-202ENSMUST00000105781 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sf3b2Q3UJB0 Skap1-206ENSMUST00000107663 742 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sf3b2Q3UJB0 Hsd17b10-202ENSMUST00000112617 992 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sf3b2Q3UJB0 4930583K01Rik-201ENSMUST00000138180 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sf3b2Q3UJB0 Plac9a-202ENSMUST00000183431 536 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sf3b2Q3UJB0 Plac9b-204ENSMUST00000184675 536 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sf3b2Q3UJB0 Gm27184-201ENSMUST00000185095 607 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sf3b2Q3UJB0 Gm4950-201ENSMUST00000091905 618 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sf3b2Q3UJB0 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sf3b2Q3UJB0 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sf3b2Q3UJB0 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sf3b2Q3UJB0 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Sf3b2Q3UJB0 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sf3b2Q3UJB0 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sf3b2Q3UJB0 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sf3b2Q3UJB0 Tubb4b-ps2-201ENSMUST00000187481 1337 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Sf3b2Q3UJB0 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sf3b2Q3UJB0 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sf3b2Q3UJB0 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sf3b2Q3UJB0 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sf3b2Q3UJB0 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sf3b2Q3UJB0 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sf3b2Q3UJB0 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sf3b2Q3UJB0 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sf3b2Q3UJB0 Jhy-201ENSMUST00000034521 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sf3b2Q3UJB0 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sf3b2Q3UJB0 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Sf3b2Q3UJB0 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sf3b2Q3UJB0 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sf3b2Q3UJB0 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sf3b2Q3UJB0 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sf3b2Q3UJB0 Ywhaz-203ENSMUST00000110361 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sf3b2Q3UJB0 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Sf3b2Q3UJB0 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sf3b2Q3UJB0 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sf3b2Q3UJB0 Rmdn1-202ENSMUST00000108253 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sf3b2Q3UJB0 Gm12029-201ENSMUST00000120073 832 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Sf3b2Q3UJB0 Gm27175-201ENSMUST00000183759 606 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sf3b2Q3UJB0 Gm27223-201ENSMUST00000184653 606 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sf3b2Q3UJB0 9230114K14Rik-203ENSMUST00000199547 437 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sf3b2Q3UJB0 Cacng1-201ENSMUST00000021065 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sf3b2Q3UJB0 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Sf3b2Q3UJB0 AC134869.3-201ENSMUST00000225581 343 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sf3b2Q3UJB0 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sf3b2Q3UJB0 Gm21411-201ENSMUST00000049821 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sf3b2Q3UJB0 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sf3b2Q3UJB0 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sf3b2Q3UJB0 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sf3b2Q3UJB0 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sf3b2Q3UJB0 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sf3b2Q3UJB0 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sf3b2Q3UJB0 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sf3b2Q3UJB0 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sf3b2Q3UJB0 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sf3b2Q3UJB0 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sf3b2Q3UJB0 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms