Protein–RNA interactions for Protein: Q3UI66

Ccdc34, Coiled-coil domain-containing protein 34, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc34Q3UI66 Olfml3-201ENSMUST00000029440 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ccdc34Q3UI66 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ccdc34Q3UI66 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ccdc34Q3UI66 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ccdc34Q3UI66 Cacna1c-227ENSMUST00000220022 7765 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ccdc34Q3UI66 Sh3tc1-201ENSMUST00000070203 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ccdc34Q3UI66 Crkl-201ENSMUST00000006293 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ccdc34Q3UI66 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ccdc34Q3UI66 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ccdc34Q3UI66 Patz1-207ENSMUST00000134089 1904 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ccdc34Q3UI66 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ccdc34Q3UI66 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ccdc34Q3UI66 Vrk1-204ENSMUST00000220629 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ccdc34Q3UI66 Tnn-202ENSMUST00000131919 3987 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ccdc34Q3UI66 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ccdc34Q3UI66 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ccdc34Q3UI66 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Ccdc34Q3UI66 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ccdc34Q3UI66 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ccdc34Q3UI66 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Ccdc34Q3UI66 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ccdc34Q3UI66 AC114573.1-201ENSMUST00000224120 1210 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Ccdc34Q3UI66 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ccdc34Q3UI66 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ccdc34Q3UI66 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ccdc34Q3UI66 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ccdc34Q3UI66 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ccdc34Q3UI66 AC122840.1-201ENSMUST00000220915 3334 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Ccdc34Q3UI66 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ccdc34Q3UI66 Cacna1c-203ENSMUST00000112790 7631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ccdc34Q3UI66 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ccdc34Q3UI66 Mpv17-202ENSMUST00000200744 1653 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ccdc34Q3UI66 Tanc1-201ENSMUST00000037526 7873 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ccdc34Q3UI66 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ccdc34Q3UI66 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ccdc34Q3UI66 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ccdc34Q3UI66 Gm26735-201ENSMUST00000180992 2649 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ccdc34Q3UI66 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ccdc34Q3UI66 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ccdc34Q3UI66 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ccdc34Q3UI66 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Ccdc34Q3UI66 Lingo4-201ENSMUST00000050975 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ccdc34Q3UI66 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ccdc34Q3UI66 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ccdc34Q3UI66 Amotl2-211ENSMUST00000153965 4222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ccdc34Q3UI66 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ccdc34Q3UI66 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ccdc34Q3UI66 Tinf2-201ENSMUST00000007733 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ccdc34Q3UI66 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ccdc34Q3UI66 Nol4-204ENSMUST00000097651 4549 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ccdc34Q3UI66 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ccdc34Q3UI66 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ccdc34Q3UI66 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Ccdc34Q3UI66 Gm28975-201ENSMUST00000186412 686 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Ccdc34Q3UI66 AC102569.1-204ENSMUST00000222816 793 ntTSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ccdc34Q3UI66 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Ccdc34Q3UI66 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ccdc34Q3UI66 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ccdc34Q3UI66 Vmn1r45-202ENSMUST00000226167 2893 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Ccdc34Q3UI66 Itga4-201ENSMUST00000099972 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ccdc34Q3UI66 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ccdc34Q3UI66 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ccdc34Q3UI66 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ccdc34Q3UI66 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ccdc34Q3UI66 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ccdc34Q3UI66 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ccdc34Q3UI66 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ccdc34Q3UI66 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ccdc34Q3UI66 Plekhm1-201ENSMUST00000041272 5968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ccdc34Q3UI66 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ccdc34Q3UI66 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Ccdc34Q3UI66 Zmynd8-203ENSMUST00000099084 5232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.15
Ccdc34Q3UI66 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Ccdc34Q3UI66 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Ccdc34Q3UI66 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Ccdc34Q3UI66 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Ccdc34Q3UI66 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Ccdc34Q3UI66 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Ccdc34Q3UI66 Bod1l-204ENSMUST00000202908 10399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Ccdc34Q3UI66 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Ccdc34Q3UI66 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Ccdc34Q3UI66 Sema6d-207ENSMUST00000103240 4372 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Ccdc34Q3UI66 Atp1b2-201ENSMUST00000047889 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Ccdc34Q3UI66 Serpinf2-202ENSMUST00000108437 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Ccdc34Q3UI66 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Ccdc34Q3UI66 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Ccdc34Q3UI66 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Ccdc34Q3UI66 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Ccdc34Q3UI66 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Ccdc34Q3UI66 Gm29331-201ENSMUST00000187215 605 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Ccdc34Q3UI66 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
Ccdc34Q3UI66 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Ccdc34Q3UI66 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Ccdc34Q3UI66 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Ccdc34Q3UI66 Iqsec2-201ENSMUST00000096275 5252 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Ccdc34Q3UI66 Vdr-201ENSMUST00000023119 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Ccdc34Q3UI66 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Ccdc34Q3UI66 Slc25a36-202ENSMUST00000085206 5227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Ccdc34Q3UI66 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Ccdc34Q3UI66 Fxr1-204ENSMUST00000197694 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.6 ms