Protein–RNA interactions for Protein: Q3U827

Rnf180, E3 ubiquitin-protein ligase RNF180, mousemouse

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Length 592 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf180Q3U827 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
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Rnf180Q3U827 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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Rnf180Q3U827 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rnf180Q3U827 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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Rnf180Q3U827 Aldh3b2-201ENSMUST00000143380 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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Rnf180Q3U827 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
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Rnf180Q3U827 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rnf180Q3U827 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rnf180Q3U827 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
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Rnf180Q3U827 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
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