Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0M1

Trappc9, Trafficking protein particle complex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc9Q3U0M1 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trappc9Q3U0M1 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trappc9Q3U0M1 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trappc9Q3U0M1 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trappc9Q3U0M1 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trappc9Q3U0M1 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trappc9Q3U0M1 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trappc9Q3U0M1 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trappc9Q3U0M1 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trappc9Q3U0M1 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trappc9Q3U0M1 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trappc9Q3U0M1 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Trappc9Q3U0M1 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trappc9Q3U0M1 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trappc9Q3U0M1 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trappc9Q3U0M1 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trappc9Q3U0M1 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trappc9Q3U0M1 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trappc9Q3U0M1 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trappc9Q3U0M1 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trappc9Q3U0M1 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trappc9Q3U0M1 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trappc9Q3U0M1 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC13.58□□□□□ -0.23
Trappc9Q3U0M1 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Trappc9Q3U0M1 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Trappc9Q3U0M1 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Trappc9Q3U0M1 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Trappc9Q3U0M1 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Trappc9Q3U0M1 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trappc9Q3U0M1 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trappc9Q3U0M1 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trappc9Q3U0M1 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trappc9Q3U0M1 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trappc9Q3U0M1 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trappc9Q3U0M1 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trappc9Q3U0M1 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trappc9Q3U0M1 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trappc9Q3U0M1 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trappc9Q3U0M1 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trappc9Q3U0M1 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trappc9Q3U0M1 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trappc9Q3U0M1 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Trappc9Q3U0M1 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Trappc9Q3U0M1 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Trappc9Q3U0M1 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trappc9Q3U0M1 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trappc9Q3U0M1 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trappc9Q3U0M1 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Trappc9Q3U0M1 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trappc9Q3U0M1 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trappc9Q3U0M1 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trappc9Q3U0M1 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trappc9Q3U0M1 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trappc9Q3U0M1 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trappc9Q3U0M1 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trappc9Q3U0M1 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trappc9Q3U0M1 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trappc9Q3U0M1 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trappc9Q3U0M1 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trappc9Q3U0M1 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trappc9Q3U0M1 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trappc9Q3U0M1 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trappc9Q3U0M1 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trappc9Q3U0M1 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trappc9Q3U0M1 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trappc9Q3U0M1 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trappc9Q3U0M1 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trappc9Q3U0M1 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trappc9Q3U0M1 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trappc9Q3U0M1 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Trappc9Q3U0M1 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trappc9Q3U0M1 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trappc9Q3U0M1 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trappc9Q3U0M1 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trappc9Q3U0M1 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trappc9Q3U0M1 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trappc9Q3U0M1 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trappc9Q3U0M1 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trappc9Q3U0M1 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trappc9Q3U0M1 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trappc9Q3U0M1 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trappc9Q3U0M1 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trappc9Q3U0M1 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trappc9Q3U0M1 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trappc9Q3U0M1 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trappc9Q3U0M1 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trappc9Q3U0M1 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trappc9Q3U0M1 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trappc9Q3U0M1 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trappc9Q3U0M1 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trappc9Q3U0M1 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trappc9Q3U0M1 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trappc9Q3U0M1 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trappc9Q3U0M1 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trappc9Q3U0M1 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trappc9Q3U0M1 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trappc9Q3U0M1 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trappc9Q3U0M1 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trappc9Q3U0M1 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trappc9Q3U0M1 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.8 ms