Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0D9

Hace1, E3 ubiquitin-protein ligase HACE1, mousemouse

Predictions only

Length 909 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hace1Q3U0D9 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Hace1Q3U0D9 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Hace1Q3U0D9 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Hace1Q3U0D9 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
Hace1Q3U0D9 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Hace1Q3U0D9 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Hace1Q3U0D9 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
Hace1Q3U0D9 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Hace1Q3U0D9 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Hace1Q3U0D9 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Hace1Q3U0D9 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
Hace1Q3U0D9 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
Hace1Q3U0D9 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Hace1Q3U0D9 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
Hace1Q3U0D9 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
Hace1Q3U0D9 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Hace1Q3U0D9 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Hace1Q3U0D9 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Hace1Q3U0D9 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Hace1Q3U0D9 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Hace1Q3U0D9 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Hace1Q3U0D9 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Hace1Q3U0D9 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Hace1Q3U0D9 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Hace1Q3U0D9 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Hace1Q3U0D9 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Hace1Q3U0D9 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Hace1Q3U0D9 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Hace1Q3U0D9 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Hace1Q3U0D9 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Hace1Q3U0D9 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Hace1Q3U0D9 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Hace1Q3U0D9 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Hace1Q3U0D9 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Hace1Q3U0D9 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Hace1Q3U0D9 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Hace1Q3U0D9 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Hace1Q3U0D9 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Hace1Q3U0D9 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Hace1Q3U0D9 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Hace1Q3U0D9 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Hace1Q3U0D9 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Hace1Q3U0D9 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Hace1Q3U0D9 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Hace1Q3U0D9 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Hace1Q3U0D9 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Hace1Q3U0D9 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Hace1Q3U0D9 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Hace1Q3U0D9 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Hace1Q3U0D9 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Hace1Q3U0D9 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Hace1Q3U0D9 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Hace1Q3U0D9 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Hace1Q3U0D9 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Hace1Q3U0D9 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Hace1Q3U0D9 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Hace1Q3U0D9 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Hace1Q3U0D9 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Hace1Q3U0D9 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Hace1Q3U0D9 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Hace1Q3U0D9 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Hace1Q3U0D9 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Hace1Q3U0D9 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Hace1Q3U0D9 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Hace1Q3U0D9 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Hace1Q3U0D9 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Hace1Q3U0D9 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Hace1Q3U0D9 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Hace1Q3U0D9 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Hace1Q3U0D9 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Hace1Q3U0D9 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Hace1Q3U0D9 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Hace1Q3U0D9 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Hace1Q3U0D9 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Hace1Q3U0D9 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Hace1Q3U0D9 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Hace1Q3U0D9 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Hace1Q3U0D9 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Hace1Q3U0D9 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Hace1Q3U0D9 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Hace1Q3U0D9 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Hace1Q3U0D9 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Hace1Q3U0D9 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Hace1Q3U0D9 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Hace1Q3U0D9 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Hace1Q3U0D9 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Hace1Q3U0D9 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Hace1Q3U0D9 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Hace1Q3U0D9 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Hace1Q3U0D9 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Hace1Q3U0D9 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Hace1Q3U0D9 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Hace1Q3U0D9 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Hace1Q3U0D9 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Hace1Q3U0D9 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Hace1Q3U0D9 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Hace1Q3U0D9 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Hace1Q3U0D9 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Hace1Q3U0D9 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Hace1Q3U0D9 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.1 ms