Protein–RNA interactions for Protein: Q3TWN3

Cnnm2, Metal transporter CNNM2, mousemouse

Predictions only

Length 875 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnnm2Q3TWN3 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cnnm2Q3TWN3 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cnnm2Q3TWN3 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cnnm2Q3TWN3 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cnnm2Q3TWN3 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cnnm2Q3TWN3 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cnnm2Q3TWN3 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Cnnm2Q3TWN3 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cnnm2Q3TWN3 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cnnm2Q3TWN3 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cnnm2Q3TWN3 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cnnm2Q3TWN3 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cnnm2Q3TWN3 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cnnm2Q3TWN3 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cnnm2Q3TWN3 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cnnm2Q3TWN3 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cnnm2Q3TWN3 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cnnm2Q3TWN3 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cnnm2Q3TWN3 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cnnm2Q3TWN3 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cnnm2Q3TWN3 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cnnm2Q3TWN3 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cnnm2Q3TWN3 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cnnm2Q3TWN3 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cnnm2Q3TWN3 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cnnm2Q3TWN3 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cnnm2Q3TWN3 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cnnm2Q3TWN3 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cnnm2Q3TWN3 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cnnm2Q3TWN3 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cnnm2Q3TWN3 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cnnm2Q3TWN3 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cnnm2Q3TWN3 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cnnm2Q3TWN3 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cnnm2Q3TWN3 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cnnm2Q3TWN3 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cnnm2Q3TWN3 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cnnm2Q3TWN3 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cnnm2Q3TWN3 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Cnnm2Q3TWN3 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Cnnm2Q3TWN3 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cnnm2Q3TWN3 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cnnm2Q3TWN3 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cnnm2Q3TWN3 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cnnm2Q3TWN3 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cnnm2Q3TWN3 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Cnnm2Q3TWN3 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cnnm2Q3TWN3 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cnnm2Q3TWN3 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cnnm2Q3TWN3 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cnnm2Q3TWN3 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cnnm2Q3TWN3 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cnnm2Q3TWN3 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cnnm2Q3TWN3 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cnnm2Q3TWN3 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cnnm2Q3TWN3 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cnnm2Q3TWN3 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cnnm2Q3TWN3 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cnnm2Q3TWN3 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cnnm2Q3TWN3 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cnnm2Q3TWN3 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cnnm2Q3TWN3 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cnnm2Q3TWN3 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Cnnm2Q3TWN3 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cnnm2Q3TWN3 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cnnm2Q3TWN3 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cnnm2Q3TWN3 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cnnm2Q3TWN3 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cnnm2Q3TWN3 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cnnm2Q3TWN3 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Cnnm2Q3TWN3 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Cnnm2Q3TWN3 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cnnm2Q3TWN3 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cnnm2Q3TWN3 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cnnm2Q3TWN3 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cnnm2Q3TWN3 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cnnm2Q3TWN3 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cnnm2Q3TWN3 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cnnm2Q3TWN3 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cnnm2Q3TWN3 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cnnm2Q3TWN3 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cnnm2Q3TWN3 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cnnm2Q3TWN3 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cnnm2Q3TWN3 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cnnm2Q3TWN3 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Cnnm2Q3TWN3 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Cnnm2Q3TWN3 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cnnm2Q3TWN3 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cnnm2Q3TWN3 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cnnm2Q3TWN3 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cnnm2Q3TWN3 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Cnnm2Q3TWN3 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cnnm2Q3TWN3 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cnnm2Q3TWN3 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cnnm2Q3TWN3 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Cnnm2Q3TWN3 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cnnm2Q3TWN3 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cnnm2Q3TWN3 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cnnm2Q3TWN3 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cnnm2Q3TWN3 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.3 ms