Protein–RNA interactions for Protein: Q3THK3

Gtf2f1, General transcription factor IIF subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2f1Q3THK3 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gtf2f1Q3THK3 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Gtf2f1Q3THK3 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Gtf2f1Q3THK3 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gtf2f1Q3THK3 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gtf2f1Q3THK3 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gtf2f1Q3THK3 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gtf2f1Q3THK3 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gtf2f1Q3THK3 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gtf2f1Q3THK3 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gtf2f1Q3THK3 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gtf2f1Q3THK3 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Gtf2f1Q3THK3 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gtf2f1Q3THK3 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gtf2f1Q3THK3 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Gtf2f1Q3THK3 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gtf2f1Q3THK3 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gtf2f1Q3THK3 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gtf2f1Q3THK3 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gtf2f1Q3THK3 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gtf2f1Q3THK3 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gtf2f1Q3THK3 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gtf2f1Q3THK3 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gtf2f1Q3THK3 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gtf2f1Q3THK3 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gtf2f1Q3THK3 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gtf2f1Q3THK3 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gtf2f1Q3THK3 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gtf2f1Q3THK3 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gtf2f1Q3THK3 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gtf2f1Q3THK3 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gtf2f1Q3THK3 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gtf2f1Q3THK3 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gtf2f1Q3THK3 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gtf2f1Q3THK3 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gtf2f1Q3THK3 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gtf2f1Q3THK3 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gtf2f1Q3THK3 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gtf2f1Q3THK3 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gtf2f1Q3THK3 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gtf2f1Q3THK3 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Gtf2f1Q3THK3 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Gtf2f1Q3THK3 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Gtf2f1Q3THK3 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gtf2f1Q3THK3 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gtf2f1Q3THK3 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gtf2f1Q3THK3 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gtf2f1Q3THK3 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gtf2f1Q3THK3 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Gtf2f1Q3THK3 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Gtf2f1Q3THK3 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gtf2f1Q3THK3 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gtf2f1Q3THK3 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gtf2f1Q3THK3 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Gtf2f1Q3THK3 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Gtf2f1Q3THK3 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Gtf2f1Q3THK3 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gtf2f1Q3THK3 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gtf2f1Q3THK3 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gtf2f1Q3THK3 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gtf2f1Q3THK3 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Gtf2f1Q3THK3 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gtf2f1Q3THK3 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gtf2f1Q3THK3 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gtf2f1Q3THK3 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Gtf2f1Q3THK3 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gtf2f1Q3THK3 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Gtf2f1Q3THK3 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gtf2f1Q3THK3 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gtf2f1Q3THK3 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gtf2f1Q3THK3 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gtf2f1Q3THK3 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gtf2f1Q3THK3 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gtf2f1Q3THK3 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gtf2f1Q3THK3 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gtf2f1Q3THK3 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gtf2f1Q3THK3 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gtf2f1Q3THK3 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gtf2f1Q3THK3 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gtf2f1Q3THK3 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gtf2f1Q3THK3 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gtf2f1Q3THK3 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gtf2f1Q3THK3 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gtf2f1Q3THK3 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gtf2f1Q3THK3 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gtf2f1Q3THK3 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gtf2f1Q3THK3 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gtf2f1Q3THK3 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gtf2f1Q3THK3 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gtf2f1Q3THK3 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gtf2f1Q3THK3 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gtf2f1Q3THK3 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gtf2f1Q3THK3 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gtf2f1Q3THK3 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gtf2f1Q3THK3 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gtf2f1Q3THK3 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gtf2f1Q3THK3 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gtf2f1Q3THK3 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gtf2f1Q3THK3 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gtf2f1Q3THK3 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77 ms