Protein–RNA interactions for Protein: Q3LR78

Zbtb38, CtBP-interacting BTB zinc finger protein, mousemouse

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Length 1,197 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbtb38Q3LR78 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zbtb38Q3LR78 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zbtb38Q3LR78 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zbtb38Q3LR78 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zbtb38Q3LR78 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zbtb38Q3LR78 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zbtb38Q3LR78 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zbtb38Q3LR78 Gm15968-201ENSMUST00000119342 1168 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Zbtb38Q3LR78 Tmsb15l-201ENSMUST00000127404 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zbtb38Q3LR78 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zbtb38Q3LR78 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Zbtb38Q3LR78 Gm38341-201ENSMUST00000195357 515 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Zbtb38Q3LR78 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zbtb38Q3LR78 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Zbtb38Q3LR78 AC156801.1-201ENSMUST00000216158 493 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zbtb38Q3LR78 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zbtb38Q3LR78 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Zbtb38Q3LR78 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zbtb38Q3LR78 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zbtb38Q3LR78 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zbtb38Q3LR78 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zbtb38Q3LR78 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zbtb38Q3LR78 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zbtb38Q3LR78 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zbtb38Q3LR78 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zbtb38Q3LR78 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zbtb38Q3LR78 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zbtb38Q3LR78 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zbtb38Q3LR78 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zbtb38Q3LR78 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zbtb38Q3LR78 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zbtb38Q3LR78 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Zbtb38Q3LR78 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zbtb38Q3LR78 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zbtb38Q3LR78 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zbtb38Q3LR78 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Zbtb38Q3LR78 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zbtb38Q3LR78 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zbtb38Q3LR78 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zbtb38Q3LR78 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zbtb38Q3LR78 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zbtb38Q3LR78 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zbtb38Q3LR78 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zbtb38Q3LR78 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zbtb38Q3LR78 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zbtb38Q3LR78 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zbtb38Q3LR78 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Zbtb38Q3LR78 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zbtb38Q3LR78 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Zbtb38Q3LR78 Rpf2-206ENSMUST00000183309 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zbtb38Q3LR78 Gm7895-201ENSMUST00000187459 1173 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Zbtb38Q3LR78 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Zbtb38Q3LR78 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Zbtb38Q3LR78 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zbtb38Q3LR78 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zbtb38Q3LR78 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zbtb38Q3LR78 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Zbtb38Q3LR78 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zbtb38Q3LR78 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zbtb38Q3LR78 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zbtb38Q3LR78 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zbtb38Q3LR78 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zbtb38Q3LR78 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zbtb38Q3LR78 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zbtb38Q3LR78 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
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Zbtb38Q3LR78 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zbtb38Q3LR78 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zbtb38Q3LR78 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zbtb38Q3LR78 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zbtb38Q3LR78 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zbtb38Q3LR78 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zbtb38Q3LR78 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zbtb38Q3LR78 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zbtb38Q3LR78 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zbtb38Q3LR78 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zbtb38Q3LR78 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zbtb38Q3LR78 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Zbtb38Q3LR78 Gm13366-201ENSMUST00000122198 970 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Zbtb38Q3LR78 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zbtb38Q3LR78 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Zbtb38Q3LR78 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zbtb38Q3LR78 AC125539.1-201ENSMUST00000227423 622 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Zbtb38Q3LR78 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zbtb38Q3LR78 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zbtb38Q3LR78 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zbtb38Q3LR78 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Zbtb38Q3LR78 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zbtb38Q3LR78 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Zbtb38Q3LR78 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zbtb38Q3LR78 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zbtb38Q3LR78 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zbtb38Q3LR78 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zbtb38Q3LR78 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zbtb38Q3LR78 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zbtb38Q3LR78 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zbtb38Q3LR78 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zbtb38Q3LR78 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zbtb38Q3LR78 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Zbtb38Q3LR78 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.7 ms