Protein–RNA interactions for Protein: Q1RLL3

Cpne9, Copine-9, mousemouse

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne9Q1RLL3 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cpne9Q1RLL3 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Cpne9Q1RLL3 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cpne9Q1RLL3 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cpne9Q1RLL3 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cpne9Q1RLL3 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cpne9Q1RLL3 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cpne9Q1RLL3 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cpne9Q1RLL3 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cpne9Q1RLL3 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cpne9Q1RLL3 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cpne9Q1RLL3 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cpne9Q1RLL3 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cpne9Q1RLL3 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cpne9Q1RLL3 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cpne9Q1RLL3 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cpne9Q1RLL3 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cpne9Q1RLL3 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cpne9Q1RLL3 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cpne9Q1RLL3 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cpne9Q1RLL3 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cpne9Q1RLL3 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cpne9Q1RLL3 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cpne9Q1RLL3 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cpne9Q1RLL3 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Cpne9Q1RLL3 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cpne9Q1RLL3 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cpne9Q1RLL3 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cpne9Q1RLL3 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cpne9Q1RLL3 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cpne9Q1RLL3 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Cpne9Q1RLL3 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cpne9Q1RLL3 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cpne9Q1RLL3 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cpne9Q1RLL3 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Cpne9Q1RLL3 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Cpne9Q1RLL3 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cpne9Q1RLL3 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cpne9Q1RLL3 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cpne9Q1RLL3 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cpne9Q1RLL3 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Cpne9Q1RLL3 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cpne9Q1RLL3 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cpne9Q1RLL3 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cpne9Q1RLL3 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cpne9Q1RLL3 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cpne9Q1RLL3 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cpne9Q1RLL3 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cpne9Q1RLL3 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cpne9Q1RLL3 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cpne9Q1RLL3 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cpne9Q1RLL3 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cpne9Q1RLL3 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cpne9Q1RLL3 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Cpne9Q1RLL3 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cpne9Q1RLL3 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cpne9Q1RLL3 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cpne9Q1RLL3 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cpne9Q1RLL3 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cpne9Q1RLL3 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cpne9Q1RLL3 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Cpne9Q1RLL3 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cpne9Q1RLL3 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cpne9Q1RLL3 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cpne9Q1RLL3 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cpne9Q1RLL3 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cpne9Q1RLL3 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cpne9Q1RLL3 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cpne9Q1RLL3 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cpne9Q1RLL3 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cpne9Q1RLL3 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cpne9Q1RLL3 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Cpne9Q1RLL3 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Cpne9Q1RLL3 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cpne9Q1RLL3 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cpne9Q1RLL3 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Cpne9Q1RLL3 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Cpne9Q1RLL3 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cpne9Q1RLL3 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cpne9Q1RLL3 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Cpne9Q1RLL3 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cpne9Q1RLL3 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cpne9Q1RLL3 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cpne9Q1RLL3 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cpne9Q1RLL3 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cpne9Q1RLL3 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cpne9Q1RLL3 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cpne9Q1RLL3 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cpne9Q1RLL3 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cpne9Q1RLL3 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cpne9Q1RLL3 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cpne9Q1RLL3 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cpne9Q1RLL3 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cpne9Q1RLL3 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cpne9Q1RLL3 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cpne9Q1RLL3 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cpne9Q1RLL3 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cpne9Q1RLL3 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cpne9Q1RLL3 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cpne9Q1RLL3 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms