Protein–RNA interactions for Protein: Q0VGT2

Gli2, Zinc finger protein GLI2, mousemouse

Predictions only

Length 1,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gli2Q0VGT2 Spert-204ENSMUST00000169658 1474 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gli2Q0VGT2 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gli2Q0VGT2 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Gli2Q0VGT2 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Gli2Q0VGT2 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gli2Q0VGT2 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gli2Q0VGT2 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gli2Q0VGT2 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gli2Q0VGT2 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gli2Q0VGT2 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gli2Q0VGT2 Mir680-2-201ENSMUST00000102163 110 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Gli2Q0VGT2 Gm23251-201ENSMUST00000103773 110 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Gli2Q0VGT2 Zscan10-203ENSMUST00000117606 891 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gli2Q0VGT2 Gm13832-202ENSMUST00000151159 370 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gli2Q0VGT2 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gli2Q0VGT2 Magohb-205ENSMUST00000173837 897 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gli2Q0VGT2 Gm43962-201ENSMUST00000203898 190 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Gli2Q0VGT2 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gli2Q0VGT2 AC160052.1-201ENSMUST00000213173 1248 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gli2Q0VGT2 Plp2-201ENSMUST00000033486 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gli2Q0VGT2 Gm21411-201ENSMUST00000049821 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gli2Q0VGT2 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gli2Q0VGT2 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gli2Q0VGT2 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gli2Q0VGT2 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gli2Q0VGT2 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gli2Q0VGT2 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gli2Q0VGT2 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gli2Q0VGT2 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gli2Q0VGT2 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gli2Q0VGT2 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gli2Q0VGT2 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gli2Q0VGT2 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gli2Q0VGT2 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gli2Q0VGT2 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gli2Q0VGT2 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gli2Q0VGT2 Gm8194-201ENSMUST00000159783 859 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Gli2Q0VGT2 Gm9230-201ENSMUST00000188228 532 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Gli2Q0VGT2 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gli2Q0VGT2 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gli2Q0VGT2 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gli2Q0VGT2 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gli2Q0VGT2 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gli2Q0VGT2 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gli2Q0VGT2 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gli2Q0VGT2 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gli2Q0VGT2 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gli2Q0VGT2 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gli2Q0VGT2 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gli2Q0VGT2 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gli2Q0VGT2 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gli2Q0VGT2 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gli2Q0VGT2 Cstad-201ENSMUST00000102853 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gli2Q0VGT2 Gm12165-201ENSMUST00000117047 342 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Gli2Q0VGT2 H2-M6-ps-201ENSMUST00000119193 1034 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Gli2Q0VGT2 Mettl1-202ENSMUST00000120542 1044 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gli2Q0VGT2 Gm12130-201ENSMUST00000133599 639 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gli2Q0VGT2 Pdzd9-203ENSMUST00000208635 1238 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gli2Q0VGT2 Ankrd2-201ENSMUST00000026172 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gli2Q0VGT2 Cd320-202ENSMUST00000087559 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gli2Q0VGT2 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gli2Q0VGT2 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gli2Q0VGT2 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gli2Q0VGT2 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gli2Q0VGT2 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gli2Q0VGT2 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gli2Q0VGT2 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gli2Q0VGT2 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gli2Q0VGT2 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gli2Q0VGT2 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gli2Q0VGT2 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gli2Q0VGT2 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gli2Q0VGT2 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Gli2Q0VGT2 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gli2Q0VGT2 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gli2Q0VGT2 Tbc1d22bos-201ENSMUST00000159875 826 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gli2Q0VGT2 Gm28778-201ENSMUST00000190734 785 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gli2Q0VGT2 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Gli2Q0VGT2 Gm43058-201ENSMUST00000197645 625 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Gli2Q0VGT2 Cct2-206ENSMUST00000219573 637 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gli2Q0VGT2 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gli2Q0VGT2 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gli2Q0VGT2 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Gli2Q0VGT2 Mir219a-1-201ENSMUST00000083621 110 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Gli2Q0VGT2 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gli2Q0VGT2 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gli2Q0VGT2 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gli2Q0VGT2 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gli2Q0VGT2 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gli2Q0VGT2 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gli2Q0VGT2 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gli2Q0VGT2 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gli2Q0VGT2 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gli2Q0VGT2 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gli2Q0VGT2 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gli2Q0VGT2 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gli2Q0VGT2 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gli2Q0VGT2 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Gli2Q0VGT2 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gli2Q0VGT2 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms