Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBD0

Itgb8, Integrin beta, mousemouse

Predictions only

Length 767 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb8Q0VBD0 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Itgb8Q0VBD0 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Itgb8Q0VBD0 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Itgb8Q0VBD0 Pygo2-202ENSMUST00000107413 2911 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Itgb8Q0VBD0 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Itgb8Q0VBD0 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Itgb8Q0VBD0 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Itgb8Q0VBD0 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Itgb8Q0VBD0 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Itgb8Q0VBD0 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Itgb8Q0VBD0 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Itgb8Q0VBD0 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Itgb8Q0VBD0 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Itgb8Q0VBD0 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Itgb8Q0VBD0 Ubxn10-201ENSMUST00000105809 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Itgb8Q0VBD0 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Itgb8Q0VBD0 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Itgb8Q0VBD0 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Itgb8Q0VBD0 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Itgb8Q0VBD0 Pcdhga11-201ENSMUST00000061279 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Itgb8Q0VBD0 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Itgb8Q0VBD0 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Itgb8Q0VBD0 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Itgb8Q0VBD0 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Itgb8Q0VBD0 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Itgb8Q0VBD0 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Itgb8Q0VBD0 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Itgb8Q0VBD0 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Itgb8Q0VBD0 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC12.27□□□□□ -0.44
Itgb8Q0VBD0 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Itgb8Q0VBD0 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Itgb8Q0VBD0 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Itgb8Q0VBD0 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Itgb8Q0VBD0 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Itgb8Q0VBD0 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Itgb8Q0VBD0 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Itgb8Q0VBD0 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Itgb8Q0VBD0 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Itgb8Q0VBD0 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Itgb8Q0VBD0 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Itgb8Q0VBD0 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Itgb8Q0VBD0 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Itgb8Q0VBD0 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Itgb8Q0VBD0 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Itgb8Q0VBD0 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Itgb8Q0VBD0 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Itgb8Q0VBD0 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Itgb8Q0VBD0 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Itgb8Q0VBD0 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Itgb8Q0VBD0 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Itgb8Q0VBD0 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Itgb8Q0VBD0 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Itgb8Q0VBD0 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Itgb8Q0VBD0 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Itgb8Q0VBD0 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Itgb8Q0VBD0 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Itgb8Q0VBD0 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Itgb8Q0VBD0 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Itgb8Q0VBD0 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Itgb8Q0VBD0 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Itgb8Q0VBD0 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Itgb8Q0VBD0 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Itgb8Q0VBD0 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Itgb8Q0VBD0 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Itgb8Q0VBD0 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Itgb8Q0VBD0 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Itgb8Q0VBD0 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Itgb8Q0VBD0 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Itgb8Q0VBD0 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Itgb8Q0VBD0 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Itgb8Q0VBD0 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Itgb8Q0VBD0 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Itgb8Q0VBD0 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Itgb8Q0VBD0 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Itgb8Q0VBD0 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Itgb8Q0VBD0 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Itgb8Q0VBD0 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Itgb8Q0VBD0 Clec10a-209ENSMUST00000178945 2332 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Itgb8Q0VBD0 Spata33-202ENSMUST00000212161 2941 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Itgb8Q0VBD0 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Itgb8Q0VBD0 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Itgb8Q0VBD0 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Itgb8Q0VBD0 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Itgb8Q0VBD0 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Itgb8Q0VBD0 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Itgb8Q0VBD0 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Itgb8Q0VBD0 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Itgb8Q0VBD0 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Itgb8Q0VBD0 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Itgb8Q0VBD0 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Itgb8Q0VBD0 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Itgb8Q0VBD0 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Itgb8Q0VBD0 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Itgb8Q0VBD0 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Itgb8Q0VBD0 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Itgb8Q0VBD0 Lta4h-201ENSMUST00000016033 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Itgb8Q0VBD0 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Itgb8Q0VBD0 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Itgb8Q0VBD0 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Itgb8Q0VBD0 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.2 ms