Protein–RNA interactions for Protein: Q0GA42

Cnnm1, Metal transporter CNNM1, mousemouse

Predictions only

Length 951 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnnm1Q0GA42 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cnnm1Q0GA42 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cnnm1Q0GA42 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cnnm1Q0GA42 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cnnm1Q0GA42 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cnnm1Q0GA42 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cnnm1Q0GA42 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cnnm1Q0GA42 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cnnm1Q0GA42 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cnnm1Q0GA42 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cnnm1Q0GA42 Gm22323-201ENSMUST00000103832 109 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Cnnm1Q0GA42 Gm15808-201ENSMUST00000119046 604 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Cnnm1Q0GA42 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cnnm1Q0GA42 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cnnm1Q0GA42 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cnnm1Q0GA42 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cnnm1Q0GA42 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cnnm1Q0GA42 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cnnm1Q0GA42 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cnnm1Q0GA42 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cnnm1Q0GA42 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cnnm1Q0GA42 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cnnm1Q0GA42 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cnnm1Q0GA42 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cnnm1Q0GA42 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cnnm1Q0GA42 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cnnm1Q0GA42 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cnnm1Q0GA42 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cnnm1Q0GA42 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cnnm1Q0GA42 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cnnm1Q0GA42 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cnnm1Q0GA42 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cnnm1Q0GA42 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cnnm1Q0GA42 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cnnm1Q0GA42 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cnnm1Q0GA42 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cnnm1Q0GA42 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cnnm1Q0GA42 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cnnm1Q0GA42 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cnnm1Q0GA42 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cnnm1Q0GA42 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cnnm1Q0GA42 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cnnm1Q0GA42 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cnnm1Q0GA42 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cnnm1Q0GA42 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cnnm1Q0GA42 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cnnm1Q0GA42 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cnnm1Q0GA42 Gm14381-201ENSMUST00000122105 414 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Cnnm1Q0GA42 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cnnm1Q0GA42 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cnnm1Q0GA42 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cnnm1Q0GA42 Gm45881-201ENSMUST00000210659 517 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cnnm1Q0GA42 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Cnnm1Q0GA42 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cnnm1Q0GA42 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cnnm1Q0GA42 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cnnm1Q0GA42 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cnnm1Q0GA42 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cnnm1Q0GA42 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Cnnm1Q0GA42 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cnnm1Q0GA42 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cnnm1Q0GA42 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cnnm1Q0GA42 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Cnnm1Q0GA42 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cnnm1Q0GA42 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cnnm1Q0GA42 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Cnnm1Q0GA42 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cnnm1Q0GA42 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Cnnm1Q0GA42 Mir877-201ENSMUST00000104738 85 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Cnnm1Q0GA42 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cnnm1Q0GA42 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cnnm1Q0GA42 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cnnm1Q0GA42 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cnnm1Q0GA42 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cnnm1Q0GA42 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Cnnm1Q0GA42 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cnnm1Q0GA42 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cnnm1Q0GA42 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cnnm1Q0GA42 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Cnnm1Q0GA42 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cnnm1Q0GA42 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Cnnm1Q0GA42 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cnnm1Q0GA42 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cnnm1Q0GA42 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cnnm1Q0GA42 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cnnm1Q0GA42 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cnnm1Q0GA42 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cnnm1Q0GA42 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cnnm1Q0GA42 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cnnm1Q0GA42 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cnnm1Q0GA42 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cnnm1Q0GA42 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cnnm1Q0GA42 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cnnm1Q0GA42 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cnnm1Q0GA42 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cnnm1Q0GA42 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cnnm1Q0GA42 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cnnm1Q0GA42 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cnnm1Q0GA42 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cnnm1Q0GA42 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms