Protein–RNA interactions for Protein: Q07646

Mest, Mesoderm-specific transcript protein, mousemouse

Predictions only

Length 335 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MestQ07646 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
MestQ07646 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
MestQ07646 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
MestQ07646 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
MestQ07646 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
MestQ07646 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
MestQ07646 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
MestQ07646 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
MestQ07646 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
MestQ07646 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
MestQ07646 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
MestQ07646 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
MestQ07646 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
MestQ07646 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
MestQ07646 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
MestQ07646 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
MestQ07646 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
MestQ07646 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
MestQ07646 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
MestQ07646 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
MestQ07646 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
MestQ07646 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
MestQ07646 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
MestQ07646 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
MestQ07646 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
MestQ07646 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
MestQ07646 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
MestQ07646 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
MestQ07646 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC11.78□□□□□ -0.52
MestQ07646 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
MestQ07646 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
MestQ07646 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
MestQ07646 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
MestQ07646 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
MestQ07646 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
MestQ07646 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
MestQ07646 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
MestQ07646 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
MestQ07646 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
MestQ07646 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
MestQ07646 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
MestQ07646 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
MestQ07646 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
MestQ07646 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
MestQ07646 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
MestQ07646 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
MestQ07646 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
MestQ07646 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
MestQ07646 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.52
MestQ07646 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
MestQ07646 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
MestQ07646 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
MestQ07646 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
MestQ07646 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
MestQ07646 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC11.77□□□□□ -0.52
MestQ07646 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
MestQ07646 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
MestQ07646 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
MestQ07646 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
MestQ07646 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
MestQ07646 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC11.77□□□□□ -0.52
MestQ07646 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC11.77□□□□□ -0.52
MestQ07646 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
MestQ07646 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
MestQ07646 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
MestQ07646 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
MestQ07646 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
MestQ07646 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
MestQ07646 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
MestQ07646 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
MestQ07646 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
MestQ07646 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
MestQ07646 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
MestQ07646 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
MestQ07646 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
MestQ07646 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
MestQ07646 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
MestQ07646 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
MestQ07646 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
MestQ07646 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
MestQ07646 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
MestQ07646 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
MestQ07646 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
MestQ07646 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
MestQ07646 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
MestQ07646 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
MestQ07646 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
MestQ07646 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
MestQ07646 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
MestQ07646 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
MestQ07646 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
MestQ07646 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
MestQ07646 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
MestQ07646 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
MestQ07646 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
MestQ07646 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
MestQ07646 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
MestQ07646 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
MestQ07646 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
MestQ07646 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.8 ms