Protein–RNA interactions for Protein: Q06986

Siah2, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH2, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah2Q06986 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Siah2Q06986 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Siah2Q06986 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Siah2Q06986 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Siah2Q06986 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Siah2Q06986 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Siah2Q06986 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Siah2Q06986 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Siah2Q06986 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Siah2Q06986 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Siah2Q06986 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Siah2Q06986 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Siah2Q06986 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Siah2Q06986 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Siah2Q06986 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Siah2Q06986 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Siah2Q06986 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Siah2Q06986 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Siah2Q06986 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Siah2Q06986 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Siah2Q06986 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Siah2Q06986 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Siah2Q06986 Tmsb15b1-201ENSMUST00000113071 439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Siah2Q06986 Ccl20-202ENSMUST00000113437 794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Siah2Q06986 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Siah2Q06986 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Siah2Q06986 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Siah2Q06986 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Siah2Q06986 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Siah2Q06986 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Siah2Q06986 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Siah2Q06986 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Siah2Q06986 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Siah2Q06986 Platr3-201ENSMUST00000146980 412 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Siah2Q06986 4930448D08Rik-201ENSMUST00000149958 1247 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Siah2Q06986 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Siah2Q06986 Gm8582-201ENSMUST00000164061 789 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Siah2Q06986 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Siah2Q06986 Gm20641-201ENSMUST00000176069 615 ntTSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Siah2Q06986 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Siah2Q06986 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Siah2Q06986 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Siah2Q06986 1700015G11Rik-202ENSMUST00000185758 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Siah2Q06986 Ccl20-203ENSMUST00000186832 772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Siah2Q06986 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Siah2Q06986 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Siah2Q06986 Gm44200-201ENSMUST00000204883 662 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Siah2Q06986 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Siah2Q06986 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Siah2Q06986 Clpb-211ENSMUST00000209579 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Siah2Q06986 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Siah2Q06986 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Siah2Q06986 Olfr1288-202ENSMUST00000214816 1326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Siah2Q06986 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Siah2Q06986 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Siah2Q06986 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Siah2Q06986 Gm7680-201ENSMUST00000216198 1348 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Siah2Q06986 AC159297.2-201ENSMUST00000219567 1075 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Siah2Q06986 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Siah2Q06986 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Siah2Q06986 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Siah2Q06986 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Siah2Q06986 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Siah2Q06986 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Siah2Q06986 Tmem212-201ENSMUST00000058077 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Siah2Q06986 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Siah2Q06986 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Siah2Q06986 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Siah2Q06986 Olfr854-201ENSMUST00000072419 948 ntAPPRIS P2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Siah2Q06986 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Siah2Q06986 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Siah2Q06986 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Siah2Q06986 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Siah2Q06986 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Siah2Q06986 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Siah2Q06986 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Siah2Q06986 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Siah2Q06986 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Siah2Q06986 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Siah2Q06986 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Siah2Q06986 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Siah2Q06986 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Siah2Q06986 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Siah2Q06986 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Siah2Q06986 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Siah2Q06986 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Siah2Q06986 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Siah2Q06986 AC130831.1-201ENSMUST00000224546 1474 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Siah2Q06986 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Siah2Q06986 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Siah2Q06986 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Siah2Q06986 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Siah2Q06986 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Siah2Q06986 Gm15161-201ENSMUST00000117340 387 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Siah2Q06986 Gm15515-201ENSMUST00000117827 822 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Siah2Q06986 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Siah2Q06986 Gm15529-201ENSMUST00000121833 994 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Siah2Q06986 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Siah2Q06986 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Siah2Q06986 Gm14024-201ENSMUST00000141964 560 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.8 ms