Protein–RNA interactions for Protein: Q06348

Prrx2, Paired mesoderm homeobox protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrx2Q06348 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Prrx2Q06348 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Prrx2Q06348 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Prrx2Q06348 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Prrx2Q06348 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Prrx2Q06348 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Prrx2Q06348 Fbp1-201ENSMUST00000092888 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Prrx2Q06348 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Prrx2Q06348 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Prrx2Q06348 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Prrx2Q06348 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Prrx2Q06348 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Prrx2Q06348 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Prrx2Q06348 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Prrx2Q06348 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Prrx2Q06348 Cd27-203ENSMUST00000112282 588 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Prrx2Q06348 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Prrx2Q06348 Gm14028-201ENSMUST00000117434 479 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Prrx2Q06348 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Prrx2Q06348 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Prrx2Q06348 Dusp13-204ENSMUST00000120984 976 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Prrx2Q06348 Gm12566-201ENSMUST00000121479 359 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Prrx2Q06348 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Prrx2Q06348 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Prrx2Q06348 Endov-204ENSMUST00000129327 1184 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Prrx2Q06348 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Prrx2Q06348 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Prrx2Q06348 Gm2453-202ENSMUST00000195508 568 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Prrx2Q06348 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Prrx2Q06348 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Prrx2Q06348 Gm38979-201ENSMUST00000207099 698 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Prrx2Q06348 Gm18212-201ENSMUST00000211678 889 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Prrx2Q06348 Gm19208-201ENSMUST00000213861 912 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Prrx2Q06348 Gm30285-201ENSMUST00000214614 422 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Prrx2Q06348 Cdc34-208ENSMUST00000219791 799 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Prrx2Q06348 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Prrx2Q06348 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Prrx2Q06348 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Prrx2Q06348 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Prrx2Q06348 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Prrx2Q06348 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Prrx2Q06348 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Prrx2Q06348 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Prrx2Q06348 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Prrx2Q06348 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Prrx2Q06348 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Prrx2Q06348 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Prrx2Q06348 Gm10782-202ENSMUST00000223775 1480 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Prrx2Q06348 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Prrx2Q06348 Spo11-203ENSMUST00000109126 1625 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Prrx2Q06348 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Prrx2Q06348 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Prrx2Q06348 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Prrx2Q06348 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Prrx2Q06348 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Prrx2Q06348 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Prrx2Q06348 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Prrx2Q06348 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Prrx2Q06348 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Prrx2Q06348 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Prrx2Q06348 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Prrx2Q06348 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Prrx2Q06348 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Prrx2Q06348 4930522L14Rik-201ENSMUST00000100937 599 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Prrx2Q06348 Gngt2-207ENSMUST00000107714 558 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Prrx2Q06348 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Prrx2Q06348 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Prrx2Q06348 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Prrx2Q06348 Gm14277-201ENSMUST00000121195 360 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Prrx2Q06348 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Prrx2Q06348 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Prrx2Q06348 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Prrx2Q06348 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Prrx2Q06348 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Prrx2Q06348 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Prrx2Q06348 2010010A06Rik-201ENSMUST00000185628 258 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Prrx2Q06348 Gm29237-201ENSMUST00000186216 448 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Prrx2Q06348 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Prrx2Q06348 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Prrx2Q06348 Gm44992-206ENSMUST00000209313 1261 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Prrx2Q06348 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Prrx2Q06348 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Prrx2Q06348 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Prrx2Q06348 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Prrx2Q06348 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Prrx2Q06348 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Prrx2Q06348 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Prrx2Q06348 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Prrx2Q06348 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Prrx2Q06348 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Prrx2Q06348 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Prrx2Q06348 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Prrx2Q06348 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Prrx2Q06348 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Prrx2Q06348 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Prrx2Q06348 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Prrx2Q06348 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Prrx2Q06348 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Prrx2Q06348 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Prrx2Q06348 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms