Protein–RNA interactions for Protein: Q03402

Crisp3, Cysteine-rich secretory protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 241 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crisp3Q03402 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Crisp3Q03402 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Crisp3Q03402 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Crisp3Q03402 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Crisp3Q03402 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Crisp3Q03402 Tmbim1-202ENSMUST00000113796 11011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Crisp3Q03402 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Crisp3Q03402 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Crisp3Q03402 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Crisp3Q03402 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Crisp3Q03402 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Crisp3Q03402 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Crisp3Q03402 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Crisp3Q03402 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Crisp3Q03402 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Crisp3Q03402 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Crisp3Q03402 Adck2-204ENSMUST00000140364 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Crisp3Q03402 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Crisp3Q03402 Lrrfip1-204ENSMUST00000097650 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Crisp3Q03402 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Crisp3Q03402 Bicra-201ENSMUST00000094821 5360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Crisp3Q03402 Klhl14-201ENSMUST00000049105 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Crisp3Q03402 Sh3tc1-201ENSMUST00000070203 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Crisp3Q03402 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Crisp3Q03402 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Crisp3Q03402 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Crisp3Q03402 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Crisp3Q03402 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Crisp3Q03402 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Crisp3Q03402 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Crisp3Q03402 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Crisp3Q03402 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Crisp3Q03402 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Crisp3Q03402 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Crisp3Q03402 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Crisp3Q03402 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Crisp3Q03402 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Crisp3Q03402 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Crisp3Q03402 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Crisp3Q03402 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Crisp3Q03402 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Crisp3Q03402 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Crisp3Q03402 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Crisp3Q03402 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Crisp3Q03402 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Crisp3Q03402 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Crisp3Q03402 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Crisp3Q03402 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Crisp3Q03402 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Crisp3Q03402 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Crisp3Q03402 Gm14685-202ENSMUST00000179117 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Crisp3Q03402 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Crisp3Q03402 Kdm5c-201ENSMUST00000082177 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Crisp3Q03402 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Crisp3Q03402 Rgs7bp-201ENSMUST00000063551 7077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Crisp3Q03402 Slc44a1-204ENSMUST00000107647 2176 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Crisp3Q03402 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Crisp3Q03402 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Crisp3Q03402 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Crisp3Q03402 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Crisp3Q03402 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Crisp3Q03402 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Crisp3Q03402 Cngb1-202ENSMUST00000119870 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Crisp3Q03402 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Crisp3Q03402 Creb3l2-201ENSMUST00000041093 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Crisp3Q03402 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Crisp3Q03402 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Crisp3Q03402 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Crisp3Q03402 Tbl1xr1-211ENSMUST00000202747 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Crisp3Q03402 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Crisp3Q03402 Evi5l-208ENSMUST00000176825 3728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Crisp3Q03402 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Crisp3Q03402 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Crisp3Q03402 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Crisp3Q03402 Kcnb1-204ENSMUST00000207917 11153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Crisp3Q03402 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Crisp3Q03402 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Crisp3Q03402 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Crisp3Q03402 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Crisp3Q03402 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Crisp3Q03402 Gm1995-201ENSMUST00000220838 2602 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Crisp3Q03402 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Crisp3Q03402 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Crisp3Q03402 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Crisp3Q03402 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Crisp3Q03402 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Crisp3Q03402 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Crisp3Q03402 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Crisp3Q03402 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Crisp3Q03402 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Crisp3Q03402 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Crisp3Q03402 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Crisp3Q03402 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Crisp3Q03402 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Crisp3Q03402 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Crisp3Q03402 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Crisp3Q03402 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Crisp3Q03402 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Crisp3Q03402 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Crisp3Q03402 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms