Protein–RNA interactions for Protein: Q02789

Cacna1s, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, mousemouse

Predictions only

Length 1,880 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1sQ02789 Ifitm10-203ENSMUST00000105988 824 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cacna1sQ02789 Gm11451-201ENSMUST00000118946 630 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Cacna1sQ02789 Agtpbp1-216ENSMUST00000168821 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cacna1sQ02789 Med8-201ENSMUST00000019229 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cacna1sQ02789 1700039I01Rik-201ENSMUST00000194370 479 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Cacna1sQ02789 Ppp1r2-ps3-201ENSMUST00000078012 627 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Cacna1sQ02789 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cacna1sQ02789 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cacna1sQ02789 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cacna1sQ02789 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cacna1sQ02789 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cacna1sQ02789 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cacna1sQ02789 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cacna1sQ02789 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cacna1sQ02789 Scoc-202ENSMUST00000167525 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cacna1sQ02789 Rps9-203ENSMUST00000108624 478 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cacna1sQ02789 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cacna1sQ02789 Aldh3b2-201ENSMUST00000143380 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cacna1sQ02789 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cacna1sQ02789 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cacna1sQ02789 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cacna1sQ02789 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cacna1sQ02789 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cacna1sQ02789 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cacna1sQ02789 AC163354.1-205ENSMUST00000223262 1511 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cacna1sQ02789 E330023G01Rik-201ENSMUST00000186387 1483 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cacna1sQ02789 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cacna1sQ02789 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cacna1sQ02789 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Cacna1sQ02789 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cacna1sQ02789 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cacna1sQ02789 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cacna1sQ02789 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cacna1sQ02789 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cacna1sQ02789 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cacna1sQ02789 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cacna1sQ02789 Pcnp-203ENSMUST00000119981 901 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cacna1sQ02789 Olfr269-ps1-201ENSMUST00000120783 302 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Cacna1sQ02789 Gm3332-201ENSMUST00000189337 928 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Cacna1sQ02789 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cacna1sQ02789 Eno3-202ENSMUST00000108548 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cacna1sQ02789 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cacna1sQ02789 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cacna1sQ02789 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cacna1sQ02789 Sh3gl3-206ENSMUST00000179318 1489 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cacna1sQ02789 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cacna1sQ02789 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cacna1sQ02789 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cacna1sQ02789 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cacna1sQ02789 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cacna1sQ02789 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cacna1sQ02789 Gm25545-201ENSMUST00000122673 323 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
Cacna1sQ02789 Smim1-206ENSMUST00000132541 490 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cacna1sQ02789 Rpl31-202ENSMUST00000178079 487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cacna1sQ02789 Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cacna1sQ02789 Gm43050-202ENSMUST00000201152 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cacna1sQ02789 Pgam2-201ENSMUST00000020768 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cacna1sQ02789 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cacna1sQ02789 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cacna1sQ02789 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cacna1sQ02789 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cacna1sQ02789 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cacna1sQ02789 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cacna1sQ02789 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cacna1sQ02789 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cacna1sQ02789 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cacna1sQ02789 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cacna1sQ02789 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cacna1sQ02789 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cacna1sQ02789 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cacna1sQ02789 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cacna1sQ02789 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cacna1sQ02789 Cd63-ps-202ENSMUST00000154992 717 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Cacna1sQ02789 Mir7677-201ENSMUST00000184226 67 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Cacna1sQ02789 Gm10550-201ENSMUST00000188846 982 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cacna1sQ02789 Gm5733-201ENSMUST00000190232 939 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Cacna1sQ02789 Gm9132-201ENSMUST00000210182 832 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Cacna1sQ02789 AC153830.1-201ENSMUST00000218522 594 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cacna1sQ02789 Sssca1-201ENSMUST00000025885 693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cacna1sQ02789 1700012P22Rik-201ENSMUST00000030323 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cacna1sQ02789 Gm9962-201ENSMUST00000085241 321 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cacna1sQ02789 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cacna1sQ02789 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cacna1sQ02789 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cacna1sQ02789 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cacna1sQ02789 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cacna1sQ02789 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cacna1sQ02789 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cacna1sQ02789 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cacna1sQ02789 Anxa11-201ENSMUST00000022416 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cacna1sQ02789 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cacna1sQ02789 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Cacna1sQ02789 Gm11634-202ENSMUST00000209862 573 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cacna1sQ02789 AC153954.1-201ENSMUST00000216959 255 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Cacna1sQ02789 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cacna1sQ02789 Nmur1-201ENSMUST00000027440 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cacna1sQ02789 Gm9873-201ENSMUST00000063891 1097 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Cacna1sQ02789 Mirlet7i-201ENSMUST00000083472 85 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Cacna1sQ02789 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cacna1sQ02789 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.3 ms