Protein–RNA interactions for Protein: Q01822

Hoxd1, Homeobox protein Hox-D1, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd1Q01822 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Hoxd1Q01822 Acoxl-201ENSMUST00000028859 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Hoxd1Q01822 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Hoxd1Q01822 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Hoxd1Q01822 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Hoxd1Q01822 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Hoxd1Q01822 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Hoxd1Q01822 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Hoxd1Q01822 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Hoxd1Q01822 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Hoxd1Q01822 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Hoxd1Q01822 AI464131-201ENSMUST00000054920 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Hoxd1Q01822 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Hoxd1Q01822 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Hoxd1Q01822 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Hoxd1Q01822 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Hoxd1Q01822 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Hoxd1Q01822 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Hoxd1Q01822 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Hoxd1Q01822 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Hoxd1Q01822 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Hoxd1Q01822 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Hoxd1Q01822 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Hoxd1Q01822 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Hoxd1Q01822 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Hoxd1Q01822 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Hoxd1Q01822 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Hoxd1Q01822 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Hoxd1Q01822 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Hoxd1Q01822 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Hoxd1Q01822 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Hoxd1Q01822 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Hoxd1Q01822 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Hoxd1Q01822 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Hoxd1Q01822 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Hoxd1Q01822 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Hoxd1Q01822 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Hoxd1Q01822 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Hoxd1Q01822 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Hoxd1Q01822 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Hoxd1Q01822 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Hoxd1Q01822 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Hoxd1Q01822 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Hoxd1Q01822 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Hoxd1Q01822 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Hoxd1Q01822 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Hoxd1Q01822 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Hoxd1Q01822 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Hoxd1Q01822 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Hoxd1Q01822 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Hoxd1Q01822 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Hoxd1Q01822 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Hoxd1Q01822 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Hoxd1Q01822 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Hoxd1Q01822 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Hoxd1Q01822 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Hoxd1Q01822 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Hoxd1Q01822 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Hoxd1Q01822 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Hoxd1Q01822 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Hoxd1Q01822 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Hoxd1Q01822 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Hoxd1Q01822 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Hoxd1Q01822 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Hoxd1Q01822 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Hoxd1Q01822 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Hoxd1Q01822 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Hoxd1Q01822 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Hoxd1Q01822 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Hoxd1Q01822 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Hoxd1Q01822 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Hoxd1Q01822 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Hoxd1Q01822 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Hoxd1Q01822 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Hoxd1Q01822 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Hoxd1Q01822 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Hoxd1Q01822 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Hoxd1Q01822 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Hoxd1Q01822 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Hoxd1Q01822 Epb41l2-204ENSMUST00000217929 3621 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Hoxd1Q01822 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Hoxd1Q01822 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Hoxd1Q01822 Rufy2-203ENSMUST00000122231 2664 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Hoxd1Q01822 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Hoxd1Q01822 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Hoxd1Q01822 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Hoxd1Q01822 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Hoxd1Q01822 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Hoxd1Q01822 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Hoxd1Q01822 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Hoxd1Q01822 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC12.27□□□□□ -0.44
Hoxd1Q01822 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Hoxd1Q01822 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Hoxd1Q01822 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Hoxd1Q01822 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Hoxd1Q01822 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Hoxd1Q01822 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Hoxd1Q01822 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Hoxd1Q01822 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Hoxd1Q01822 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.9 ms