Protein–RNA interactions for Protein: Q01149

Col1a2, Collagen alpha-2(I) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col1a2Q01149 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Col1a2Q01149 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Col1a2Q01149 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Col1a2Q01149 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Col1a2Q01149 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Col1a2Q01149 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Col1a2Q01149 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Col1a2Q01149 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Col1a2Q01149 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Col1a2Q01149 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Col1a2Q01149 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Col1a2Q01149 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Col1a2Q01149 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Col1a2Q01149 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Col1a2Q01149 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Col1a2Q01149 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Col1a2Q01149 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Col1a2Q01149 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Col1a2Q01149 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Col1a2Q01149 Gm14381-201ENSMUST00000122105 414 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Col1a2Q01149 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Col1a2Q01149 Gm17376-201ENSMUST00000166016 84 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Col1a2Q01149 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Col1a2Q01149 Gm5441-202ENSMUST00000190132 449 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Col1a2Q01149 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Col1a2Q01149 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Col1a2Q01149 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Col1a2Q01149 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Col1a2Q01149 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Col1a2Q01149 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Col1a2Q01149 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Col1a2Q01149 Mirlet7c-2-201ENSMUST00000083674 95 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Col1a2Q01149 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Col1a2Q01149 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Col1a2Q01149 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Col1a2Q01149 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Col1a2Q01149 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Col1a2Q01149 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Col1a2Q01149 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Col1a2Q01149 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Col1a2Q01149 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Col1a2Q01149 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Col1a2Q01149 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Col1a2Q01149 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Col1a2Q01149 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Col1a2Q01149 4933407E24Rik-201ENSMUST00000133499 969 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Col1a2Q01149 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Col1a2Q01149 Gm20482-202ENSMUST00000174729 825 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Col1a2Q01149 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Col1a2Q01149 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Col1a2Q01149 Gm30285-201ENSMUST00000214614 422 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Col1a2Q01149 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Col1a2Q01149 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Col1a2Q01149 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Col1a2Q01149 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Col1a2Q01149 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Col1a2Q01149 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Col1a2Q01149 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Col1a2Q01149 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Col1a2Q01149 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Col1a2Q01149 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Col1a2Q01149 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Col1a2Q01149 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Col1a2Q01149 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Col1a2Q01149 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Col1a2Q01149 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Col1a2Q01149 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Col1a2Q01149 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Col1a2Q01149 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Col1a2Q01149 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Col1a2Q01149 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Col1a2Q01149 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Col1a2Q01149 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Col1a2Q01149 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Col1a2Q01149 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Col1a2Q01149 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Col1a2Q01149 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Col1a2Q01149 Pdlim2-205ENSMUST00000129174 729 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Col1a2Q01149 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Col1a2Q01149 Gm4959-201ENSMUST00000197271 1044 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Col1a2Q01149 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Col1a2Q01149 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Col1a2Q01149 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Col1a2Q01149 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Col1a2Q01149 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Col1a2Q01149 Gm12166-201ENSMUST00000093169 958 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Col1a2Q01149 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Col1a2Q01149 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Col1a2Q01149 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Col1a2Q01149 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Col1a2Q01149 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Col1a2Q01149 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Col1a2Q01149 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Col1a2Q01149 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Col1a2Q01149 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Col1a2Q01149 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Col1a2Q01149 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Col1a2Q01149 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Col1a2Q01149 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Col1a2Q01149 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms