Protein–RNA interactions for Protein: Q00651

Itga4, Integrin alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,039 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga4Q00651 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Itga4Q00651 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Itga4Q00651 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Itga4Q00651 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Itga4Q00651 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Itga4Q00651 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Itga4Q00651 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Itga4Q00651 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Itga4Q00651 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Itga4Q00651 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Itga4Q00651 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Itga4Q00651 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Itga4Q00651 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Itga4Q00651 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Itga4Q00651 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Itga4Q00651 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Itga4Q00651 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Itga4Q00651 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Itga4Q00651 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Itga4Q00651 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Itga4Q00651 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Itga4Q00651 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Itga4Q00651 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Itga4Q00651 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Itga4Q00651 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Itga4Q00651 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Itga4Q00651 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Itga4Q00651 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Itga4Q00651 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Itga4Q00651 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Itga4Q00651 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Itga4Q00651 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Itga4Q00651 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Itga4Q00651 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Itga4Q00651 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Itga4Q00651 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Itga4Q00651 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Itga4Q00651 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Itga4Q00651 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Itga4Q00651 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Itga4Q00651 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Itga4Q00651 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Itga4Q00651 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Itga4Q00651 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Itga4Q00651 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Itga4Q00651 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Itga4Q00651 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Itga4Q00651 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Itga4Q00651 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Itga4Q00651 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Itga4Q00651 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Itga4Q00651 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Itga4Q00651 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Itga4Q00651 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Itga4Q00651 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Itga4Q00651 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Itga4Q00651 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Itga4Q00651 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Itga4Q00651 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Itga4Q00651 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Itga4Q00651 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Itga4Q00651 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Itga4Q00651 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Itga4Q00651 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Itga4Q00651 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Itga4Q00651 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Itga4Q00651 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Itga4Q00651 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Itga4Q00651 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Itga4Q00651 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Itga4Q00651 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Itga4Q00651 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Itga4Q00651 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Itga4Q00651 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Itga4Q00651 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Itga4Q00651 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Itga4Q00651 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Itga4Q00651 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Itga4Q00651 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Itga4Q00651 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Itga4Q00651 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Itga4Q00651 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Itga4Q00651 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Itga4Q00651 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Itga4Q00651 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Itga4Q00651 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Itga4Q00651 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Itga4Q00651 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Itga4Q00651 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Itga4Q00651 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Itga4Q00651 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Itga4Q00651 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Itga4Q00651 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Itga4Q00651 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Itga4Q00651 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Itga4Q00651 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Itga4Q00651 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Itga4Q00651 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Itga4Q00651 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Itga4Q00651 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.3 ms