Protein–RNA interactions for Protein: Q00623

Apoa1, Apolipoprotein A-I, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoa1Q00623 Ctdspl2-201ENSMUST00000036647 5053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Apoa1Q00623 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Apoa1Q00623 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Apoa1Q00623 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Apoa1Q00623 Gm43061-201ENSMUST00000198850 2241 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Apoa1Q00623 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Apoa1Q00623 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Apoa1Q00623 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Apoa1Q00623 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Apoa1Q00623 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Apoa1Q00623 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Apoa1Q00623 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Apoa1Q00623 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Apoa1Q00623 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Apoa1Q00623 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Apoa1Q00623 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Apoa1Q00623 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Apoa1Q00623 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Apoa1Q00623 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Apoa1Q00623 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Apoa1Q00623 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Apoa1Q00623 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Apoa1Q00623 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Apoa1Q00623 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Apoa1Q00623 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Apoa1Q00623 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Apoa1Q00623 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Apoa1Q00623 Fzd4-201ENSMUST00000058755 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Apoa1Q00623 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Apoa1Q00623 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Apoa1Q00623 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Apoa1Q00623 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Apoa1Q00623 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Apoa1Q00623 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Apoa1Q00623 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Apoa1Q00623 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Apoa1Q00623 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Apoa1Q00623 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Apoa1Q00623 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Apoa1Q00623 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Apoa1Q00623 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Apoa1Q00623 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Apoa1Q00623 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Apoa1Q00623 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Apoa1Q00623 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Apoa1Q00623 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Apoa1Q00623 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Apoa1Q00623 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Apoa1Q00623 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Apoa1Q00623 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Apoa1Q00623 Gm4780-202ENSMUST00000215200 2644 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Apoa1Q00623 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Apoa1Q00623 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Apoa1Q00623 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Apoa1Q00623 Myo18a-210ENSMUST00000130305 5450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Apoa1Q00623 Sec16a-202ENSMUST00000114082 8797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Apoa1Q00623 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Apoa1Q00623 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Apoa1Q00623 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Apoa1Q00623 Gfod2-201ENSMUST00000013294 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Apoa1Q00623 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Apoa1Q00623 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Apoa1Q00623 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Apoa1Q00623 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Apoa1Q00623 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Apoa1Q00623 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Apoa1Q00623 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Apoa1Q00623 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Apoa1Q00623 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Apoa1Q00623 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Apoa1Q00623 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Apoa1Q00623 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Apoa1Q00623 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Apoa1Q00623 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Apoa1Q00623 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Apoa1Q00623 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Apoa1Q00623 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Apoa1Q00623 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Apoa1Q00623 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Apoa1Q00623 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Apoa1Q00623 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Apoa1Q00623 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Apoa1Q00623 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Apoa1Q00623 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Apoa1Q00623 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Apoa1Q00623 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Apoa1Q00623 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Apoa1Q00623 AI464131-201ENSMUST00000054920 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Apoa1Q00623 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Apoa1Q00623 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Apoa1Q00623 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Apoa1Q00623 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Apoa1Q00623 Ints6-202ENSMUST00000223585 10883 ntAPPRIS P1 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Apoa1Q00623 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Apoa1Q00623 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Apoa1Q00623 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Apoa1Q00623 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Apoa1Q00623 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Apoa1Q00623 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Apoa1Q00623 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms