Protein–RNA interactions for Protein: Q00288

Pax8, Paired box protein Pax-8, mousemouse

Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax8Q00288 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Pax8Q00288 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Pax8Q00288 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Pax8Q00288 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Pax8Q00288 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Pax8Q00288 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Pax8Q00288 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Pax8Q00288 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Pax8Q00288 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Pax8Q00288 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Pax8Q00288 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Pax8Q00288 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Pax8Q00288 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Pax8Q00288 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Pax8Q00288 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Pax8Q00288 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Pax8Q00288 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Pax8Q00288 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Pax8Q00288 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Pax8Q00288 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Pax8Q00288 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Pax8Q00288 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Pax8Q00288 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Pax8Q00288 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Pax8Q00288 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Pax8Q00288 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Pax8Q00288 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Pax8Q00288 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Pax8Q00288 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Pax8Q00288 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Pax8Q00288 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Pax8Q00288 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Pax8Q00288 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Pax8Q00288 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Pax8Q00288 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Pax8Q00288 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Pax8Q00288 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Pax8Q00288 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Pax8Q00288 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Pax8Q00288 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Pax8Q00288 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Pax8Q00288 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Pax8Q00288 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Pax8Q00288 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Pax8Q00288 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Pax8Q00288 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Pax8Q00288 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Pax8Q00288 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Pax8Q00288 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Pax8Q00288 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Pax8Q00288 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Pax8Q00288 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Pax8Q00288 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Pax8Q00288 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Pax8Q00288 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Pax8Q00288 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Pax8Q00288 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Pax8Q00288 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Pax8Q00288 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Pax8Q00288 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Pax8Q00288 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Pax8Q00288 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Pax8Q00288 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Pax8Q00288 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Pax8Q00288 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Pax8Q00288 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Pax8Q00288 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Pax8Q00288 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Pax8Q00288 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Pax8Q00288 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Pax8Q00288 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Pax8Q00288 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Pax8Q00288 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Pax8Q00288 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Pax8Q00288 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Pax8Q00288 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Pax8Q00288 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Pax8Q00288 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Pax8Q00288 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Pax8Q00288 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Pax8Q00288 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Pax8Q00288 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Pax8Q00288 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Pax8Q00288 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Pax8Q00288 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Pax8Q00288 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Pax8Q00288 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Pax8Q00288 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Pax8Q00288 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Pax8Q00288 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Pax8Q00288 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Pax8Q00288 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Pax8Q00288 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Pax8Q00288 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Pax8Q00288 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Pax8Q00288 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Pax8Q00288 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Pax8Q00288 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Pax8Q00288 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Pax8Q00288 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms