Protein–RNA interactions for Protein: P97432

Nbr1, Next to BRCA1 gene 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 988 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nbr1P97432 Gm6082-201ENSMUST00000215204 454 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Nbr1P97432 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Nbr1P97432 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nbr1P97432 Gm9843-201ENSMUST00000052867 504 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nbr1P97432 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nbr1P97432 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nbr1P97432 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nbr1P97432 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Nbr1P97432 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nbr1P97432 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nbr1P97432 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nbr1P97432 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nbr1P97432 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nbr1P97432 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nbr1P97432 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nbr1P97432 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nbr1P97432 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nbr1P97432 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nbr1P97432 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nbr1P97432 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nbr1P97432 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nbr1P97432 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nbr1P97432 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Nbr1P97432 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nbr1P97432 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nbr1P97432 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nbr1P97432 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nbr1P97432 Gm13442-201ENSMUST00000135749 663 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nbr1P97432 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nbr1P97432 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nbr1P97432 Ldlrad2-201ENSMUST00000178923 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nbr1P97432 Anapc16-202ENSMUST00000182116 581 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nbr1P97432 Gm45339-201ENSMUST00000210823 877 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nbr1P97432 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nbr1P97432 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Nbr1P97432 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nbr1P97432 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nbr1P97432 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nbr1P97432 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nbr1P97432 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nbr1P97432 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nbr1P97432 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Nbr1P97432 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Nbr1P97432 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nbr1P97432 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nbr1P97432 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nbr1P97432 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nbr1P97432 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nbr1P97432 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nbr1P97432 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nbr1P97432 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nbr1P97432 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nbr1P97432 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nbr1P97432 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nbr1P97432 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nbr1P97432 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nbr1P97432 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nbr1P97432 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nbr1P97432 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nbr1P97432 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nbr1P97432 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nbr1P97432 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nbr1P97432 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nbr1P97432 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nbr1P97432 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nbr1P97432 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nbr1P97432 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nbr1P97432 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Nbr1P97432 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nbr1P97432 Gm17376-201ENSMUST00000166016 84 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Nbr1P97432 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nbr1P97432 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nbr1P97432 Gm4819-201ENSMUST00000182170 1009 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Nbr1P97432 Gm5441-202ENSMUST00000190132 449 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nbr1P97432 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Nbr1P97432 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Nbr1P97432 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nbr1P97432 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nbr1P97432 AC154532.1-201ENSMUST00000227860 965 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Nbr1P97432 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nbr1P97432 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nbr1P97432 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nbr1P97432 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nbr1P97432 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nbr1P97432 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nbr1P97432 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nbr1P97432 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nbr1P97432 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nbr1P97432 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nbr1P97432 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nbr1P97432 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nbr1P97432 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nbr1P97432 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nbr1P97432 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nbr1P97432 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nbr1P97432 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nbr1P97432 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nbr1P97432 Gm45765-202ENSMUST00000212921 1313 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nbr1P97432 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nbr1P97432 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms