Protein–RNA interactions for Protein: P97371

Psme1, Proteasome activator complex subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 249 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psme1P97371 Gm8913-201ENSMUST00000209491 641 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Psme1P97371 AC073947.1-201ENSMUST00000216991 649 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Psme1P97371 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Psme1P97371 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Psme1P97371 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Psme1P97371 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Psme1P97371 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Psme1P97371 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Psme1P97371 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Psme1P97371 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Psme1P97371 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Psme1P97371 Mapk8-204ENSMUST00000111944 1528 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Psme1P97371 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Psme1P97371 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Psme1P97371 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Psme1P97371 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Psme1P97371 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Psme1P97371 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Psme1P97371 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Psme1P97371 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Psme1P97371 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Psme1P97371 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Psme1P97371 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Psme1P97371 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Psme1P97371 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Psme1P97371 Limd2-203ENSMUST00000106875 936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Psme1P97371 Dynlrb1-202ENSMUST00000109682 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Psme1P97371 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Psme1P97371 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Psme1P97371 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Psme1P97371 Gm27552-201ENSMUST00000183351 62 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Psme1P97371 Gm27844-201ENSMUST00000183613 62 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Psme1P97371 Gm37835-201ENSMUST00000193305 361 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Psme1P97371 Gm44136-201ENSMUST00000203819 1106 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Psme1P97371 AC153937.1-201ENSMUST00000218734 412 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Psme1P97371 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Psme1P97371 Gm10702-201ENSMUST00000098929 1268 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Psme1P97371 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Psme1P97371 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Psme1P97371 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Psme1P97371 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Psme1P97371 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Psme1P97371 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Psme1P97371 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Psme1P97371 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Psme1P97371 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Psme1P97371 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Psme1P97371 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Psme1P97371 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Psme1P97371 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Psme1P97371 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Psme1P97371 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Psme1P97371 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Psme1P97371 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Psme1P97371 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Psme1P97371 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Psme1P97371 Ccl27a-203ENSMUST00000108033 428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Psme1P97371 Zar1l-201ENSMUST00000118769 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Psme1P97371 Crls1-204ENSMUST00000124836 1267 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Psme1P97371 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Psme1P97371 Ly6g5c-201ENSMUST00000037849 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Psme1P97371 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Psme1P97371 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Psme1P97371 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Psme1P97371 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Psme1P97371 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Psme1P97371 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Psme1P97371 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Psme1P97371 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Psme1P97371 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Psme1P97371 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Psme1P97371 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Psme1P97371 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Psme1P97371 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Psme1P97371 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Psme1P97371 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Psme1P97371 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Psme1P97371 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Psme1P97371 Cisd3-201ENSMUST00000107583 737 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Psme1P97371 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Psme1P97371 Gm9550-201ENSMUST00000161130 862 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Psme1P97371 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Psme1P97371 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Psme1P97371 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Psme1P97371 Gm7467-201ENSMUST00000185173 652 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Psme1P97371 Gm7003-201ENSMUST00000195089 312 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Psme1P97371 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Psme1P97371 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Psme1P97371 Acsm5-207ENSMUST00000207813 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Psme1P97371 Gm45433-201ENSMUST00000209386 247 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Psme1P97371 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Psme1P97371 Olfr398-201ENSMUST00000053874 945 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Psme1P97371 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Psme1P97371 Spatc1l-201ENSMUST00000009259 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Psme1P97371 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Psme1P97371 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Psme1P97371 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Psme1P97371 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Psme1P97371 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Psme1P97371 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms